| 染色质开放状态对结肠癌相关功能通路影响的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 康争春,闫飞虎,王振,赵子夜,于恩达,邢俊杰. 染色质开放状态对结肠癌相关功能通路影响的生物信息学分析[J]. 第二军医大学学报, 2021, 42(7): 762-769. DOI: 10.16781/j.0258-879x.2021.07.0762 |
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| 作者姓名： | 康争春 闫飞虎 王振 赵子夜 于恩达 邢俊杰 |
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| 作者单位： | 海军军医大学(第二军医大学)长海医院肛肠外科,上海 200433 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目（81802434）；国家博士后科学基金面上项目（45862）；海军军医大学（第二军医大学）长海医院教学研究与改革项目（CHJG2020023）；国家自然科学基金面上项目（81870455）；海军军医大学（第二军医大学）长海医院“234学科攀峰计划”项目（2019YXK036）；海军军医大学（第二军医大学）教学成果立项培育项目（JPY2020B29）；海军军医大学“深蓝”人才工程，“启航计划”资助（文件编号：海医政202128号） |
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| 摘 要： | 目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库的染色质开放性高通量测序(ATAC-seq)数据和转录组测序(RNA-seq)数据,探索染色质开放状态对结肠癌相关功能通路的影响.方法 从TCGA数据库下载结肠癌ATAC-seq数据和RNA-seq数据,使用R 3.5.3软件对ATAC-seq数据进行质量控制.对全部样本ATA...
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| 关 键 词： | 结肠肿瘤 癌症基因组图谱 高通量测序 染色质开放性 |
| 收稿时间： | 2021-01-16 |
| 修稿时间： | 2021-06-30 |
Bioinformatics analysis of the effect of chromatin opening state on the related functional pathways of colon cancer |
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| Kang Zhengchun,Yan Feihu,Wang Zhen,Zhao Ziye,Yu Enda and Xing Junjie. Bioinformatics analysis of the effect of chromatin opening state on the related functional pathways of colon cancer[J]. Former Academic Journal of Second Military Medical University, 2021, 42(7): 762-769. DOI: 10.16781/j.0258-879x.2021.07.0762 |
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| Authors: | Kang Zhengchun Yan Feihu Wang Zhen Zhao Ziye Yu Enda Xing Junjie |
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| Affiliation: | Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity,Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity,Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity,Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity,Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity,Department of Colorectal Surgery,Changhai Hospital,Naval Medical Uneversity |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | colon cancer ATAC-seq open chromatin |
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