| 食管鳞状细胞癌差异性表达circRNA的初步筛选和分析 |
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| 引用本文： | 张德海,付正,王健,王国君,黄军贤,陈熹.食管鳞状细胞癌差异性表达circRNA的初步筛选和分析[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2020,27(9):1012-1017. |
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| 作者姓名： | 张德海 付正 王健 王国君 黄军贤 陈熹 |
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| 作者单位： | 1.江苏大学附属金坛医院 胸外科，金坛 213200; 2.南京大学生命科学学院，南京 210023 |
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| 基金项目： | 常 州 市 金 坛 区 科 学 技 术 局 社 会 发 展 项 目（No.KJ201727） |
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| 摘 要： | 目的：构建食管鳞状细胞癌的 circRNA 表达谱 ，分析差异性表达的 circRNA。方法：标本取自 2018 年 6 月至2019年2月在江苏大学附属金坛医院胸外科住院的3例食管鳞状细胞癌手术患者，利用高通量测序技术构建circRNA表达谱，检测3对食管鳞状细胞癌组织和癌旁组织中差异表达的circRNA，并运用GO和KEGG技术分析这些circRNA涉及的生物学作用和相关的信号通路。结果：通过构建的表达谱分析比较食管鳞状细胞癌组织与癌旁组织circRNA的表达水平，共发现了905个差异表达的circRNA，其中404个表达上调、501个表达下调，hsa_circ_0004390是上调倍数最大的circRNA（FC=7.9712），novel_circ_0012687是下调倍数最大的circRNA（FC=5.8796）。GO和KEGG分析表明，这些circRNA可能涉及癌细胞的细胞周期、细胞组分、蛋白质结合作用等生物学过程和Hippo、cGMP-PKG等信号通路。结论：食管鳞状细胞癌组织circRNA表达谱分析得到的高度显著差异表达的circRNA似可以作为食管鳞状细胞癌潜在的生物标志物。
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| 关 键 词： | 食管鳞状细胞癌 环状RNA 差异表达 生物学作用 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2020/3/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/7/14 0:00:00 |
Preliminary screening and analysis of differentially expressed circRNAs in esophageal squamous cell carcinoma |
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| ZHANG Dehai,FU Zheng,WANG Jian,WANG Guojun,HUANG Junxian,CHEN Xi.Preliminary screening and analysis of differentially expressed circRNAs in esophageal squamous cell carcinoma[J].Chinese Journal of Cancer Biotherapy,2020,27(9):1012-1017. |
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| Authors: | ZHANG Dehai FU Zheng WANG Jian WANG Guojun HUANG Junxian CHEN Xi |
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| Institution: | 1. Department of Thoracic Surgery, Jintan Hospital Affiliated to Jiangsu University, Jintan 213200, Jiangsu, China; 2. College of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing 210023, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | esophageal squamous cell carcinoma circRNA differential expression biological function high throughput sequencing |
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