北京地区六岁以下儿童急性呼吸道偏肺病毒感染 |
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引用本文: | 王新宁, 苏艳艳, 吴忠兰, 曹慜, 李龙山, 裴建新, 马学平. 宁夏地区呼吸道人偏肺病毒全基因组特征分析[J]. 中国公共卫生, 2023, 39(7): 918-923. DOI: 10.11847/zgggws1140765 |
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作者姓名: | 王新宁 苏艳艳 吴忠兰 曹慜 李龙山 裴建新 马学平 |
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作者单位: | 1.宁夏回族自治区疾病预防控制中心,银川 750003;2.宁夏医科大学公共卫生与管理学院,银川 750004;3.宁夏环境因素与慢性病控制重点实验室,银川 750004 |
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基金项目: | 宁夏重点研发项目(2020BEG01001);宁夏青年拔尖人才培养工程项目(RQ0049); |
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摘 要: | 目的 了解宁夏地区人偏肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV)的全基因组特征,丰富我国hMPV基因组数据库。 方法 在宁夏地区2021年呼吸道病毒病原学监测的阳性样本库中,选择2例hMPV咽拭子样本进行全基因组测序,并与国家生物技术信息中心(NCBI)下载的27株hMPV各基因型别代表株进行生物信息学分析,使用MEGA 7.0构建系统发育进化树和遗传距离的计算,使用DNAStar 7.1软件包中的MegAlign 7.1进行氨基酸和核苷酸同源性分析。 结果 G蛋白基因组序列、F蛋白基因组序列和全基因组序列亲缘关系进化树均显示,2例hMPV与B2型在同一分支上;hMPV/NX01/2021、hMPV/NX02/2021全基因组序列与2020年澳大利亚毒株(MW221994)全基因组序列的氨基酸距离(核苷酸距离)最近,分别为0.005(0.002)、0.006(0.003);2例hMPV在全基因组序列及各个蛋白基因组序列(N、P、M、F、M2-1、M2-2、SH、G、L)均与hMPV-B2型的平均氨基酸和核苷酸同源性最高。 结论 宁夏地区2例呼吸道人偏肺病毒均属于hMPV-B2基因型。
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关 键 词: | 人偏肺病毒 全基因组 基因特征 |
收稿时间: | 2022-11-05 |
修稿时间: | 2023-01-11 |
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