| 三氧化二砷诱导NB4细胞凋亡相关基因表达改变的基因芯片研究 |
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| 引用本文： | 秦大兵,陈洁平,王升启. 三氧化二砷诱导NB4细胞凋亡相关基因表达改变的基因芯片研究[J]. 解放军医学杂志, 2007, 32(5): 496-499 |
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| 作者姓名： | 秦大兵 陈洁平 王升启 |
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| 作者单位： | 400038,重庆,第三军医大学西南医院血液科;军事医学科学院放射与辐射研究所 |
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| 基金项目： | 第三军医大学校科研和教改项目 |
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| 摘 要： | 目的 利用基因芯片技术研究NB4细胞经三氧化二砷(As2O3)诱导凋亡后的凋亡相关基因表达变化.方法 检索NCBI的Entrez以及Human IPI数据库,通过染色体定位来排除冗余基因,共获得1 384个凋亡相关基因.探针使用软件OligoArray 2.0设计,并作Blast比对.设计基因特异寡核苷酸探针,合成后点样,制备寡核苷酸芯片.用2μmol/L的As2O3处理NB4细胞48h后,提取细胞总RNA,分别以Cy3,Cy5标记对照组及实验组,随后与含1 384个凋亡相关基因的寡核苷酸芯片杂交,使用基因芯片扫描仪对杂交信号扫描,软件分析Cy3和Cy5两种荧光信号的强度和比值,找出经As2O3处理后出现差异表达的基因,并挑选其中差异表达最明显的4条基因,设计引物后与CNDA产物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳进行验证.结果 NB4细胞经2μmol/L As2O3作用48h后共有4个基因表达上调,12个基因表达下调,且RT-PCR验证结果与基因芯片结果完全相符.结论 As2O3可以诱导NB4细胞一系列基因表达的改变,这些涉及信号转导、转录调节、细胞周期、氧化应激、蛋白质的翻译合成及细胞分化等方面基因的差异表达,可能在NB4细胞凋亡中起着重要作用.
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| 关 键 词： | 三氧化二砷 NB4细胞 细胞凋亡 基因芯片 |
| 收稿时间： | 2007-01-05 |
| 修稿时间： | 2007-03-01 |
Studies with an oligonucleotide microarray on the changes of gene expression related with NB4 apoptosis induced by arsenic trioxide |
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| Qin Dabing,Chen Jieping,Wang Shenqi. Studies with an oligonucleotide microarray on the changes of gene expression related with NB4 apoptosis induced by arsenic trioxide[J]. Medical Journal of Chinese People's Liberation Army, 2007, 32(5): 496-499 |
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| Authors: | Qin Dabing Chen Jieping Wang Shenqi |
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| Affiliation: | Department of Hematology, Southwest Hospital, Third Military Medcial University, ChongQing 400038, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | arsenic trioxide NB4 cells apoptosis oligonucleotide micmarray |
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