| 一株急性散发性戊型肝炎病毒基因结构及核苷酸同源性分析 |
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| 引用本文： | 刘子玲,迟宝荣,高桥和明,三代俊治. 一株急性散发性戊型肝炎病毒基因结构及核苷酸同源性分析[J]. 吉林大学学报(医学版), 2006, 32(6): 1052-1054. DOI: 国际合作项目(＊东北地区肝病疫学调研)资助 |
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| 作者姓名： | 刘子玲 迟宝荣 高桥和明 三代俊治 |
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| 作者单位： | 1. 吉林大学第一医院血液科，吉林 长春130021；2. 吉林大学第一医院消化内科，吉林 长春 130021；3.日本东芝病院肝病研究所，日本 东京 〒140-8522 |
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| 基金项目： | 国际合作项目(中国东北地区肝病疫学调研)资助项目 |
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| 摘 要： | 目的：分析一株长春地区散发戊型肝炎病毒（HEV）的基因结构和核苷酸同源性。方法：采用RT-nPCR方法检测HEV RNA，应用全自动测序仪进行序列测定。结果：所获得的HEV-CCC220全长7 193bp，编码2 397个氨基酸，由5′-UTR（nt 1-9）、3′-UTR（nt 7152-7193）和3个开放读码框架（ORFs）组成。与HEV Ⅳ型核苷酸同源性明显高于HEVⅠ～Ⅲ型，全基因序列核苷酸同源性为83.2 %～85.0%；与ORF2间300 nt和98 nt部分基因序列核苷酸同源性分别为85.0%～93.9%和80.6%～86.7%。结论：长春地区散发性HEV-CCC220属HEV Ⅳ型，ORF2间300nt部分核苷酸序列可以代替全基因序列进行HEV基因型分析。
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| 关 键 词： | 戊型 基因 结构 病毒 序列同源性 核酸 序列分析 |
| 文章编号： | 1671-587X(2006)06-1052-03 |
| 收稿时间： | 2005-06-23 |
| 修稿时间： | 2005-06-23 |
Analysis of HEV genetic structure and nucleotide homology isolated from sporadic acute hepatitis E in Changchun |
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| LIU Zi-ling,CHI Bao-rong,KAZUAKI Takahashi,SHUNJI Mishiro. Analysis of HEV genetic structure and nucleotide homology isolated from sporadic acute hepatitis E in Changchun[J]. Journal of Jilin University: Med Ed, 2006, 32(6): 1052-1054. DOI: 国际合作项目(＊东北地区肝病疫学调研)资助 |
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| Authors: | LIU Zi-ling CHI Bao-rong KAZUAKI Takahashi SHUNJI Mishiro |
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| Affiliation: | 1.Department of Hematology,First Hospital,Jilin University,Changchun 130021,China; 2.Department of Digestive Medicine,First Hospital,Jilin University,Changchun 130021,China; 3.Institutes of Hepatic Disease,Toshiba General Hospital,Tokyo 〒140-8522,Japan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | hepatitis E virus genetic structure viral sequence homology nucleic acid sequence analysis |
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