广东HCV进化与注射吸毒者HCV NS5B区正向选择位点的分析研究 |
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引用本文: | 王敏,许茹,廖峭,钟惠珊,黄杰庭,杜荣松,单振刚,戎霞,付涌水.广东HCV进化与注射吸毒者HCV NS5B区正向选择位点的分析研究[J].中国输血杂志,2022(6):597-601. |
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作者姓名: | 王敏 许茹 廖峭 钟惠珊 黄杰庭 杜荣松 单振刚 戎霞 付涌水 |
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作者单位: | 广州血液中心广州市血液安全重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32000666);;广东省自然科学基金(2020A1515010118); |
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摘 要: | 目的 了解广东HCV进化与注射吸毒者(IDUs)HCV NS5B区正向位点的选择压力情况。方法 随机收集广东141(人)份HCV RNA阳性献血者和58(人)份HCV患者标本做HCV NS5B序列扩增,结合前期测序得到的2009年~2011年的献血者和IDUs HCV NS5B序列,用分子进化遗传学分析(MEGA)软件做同源性分析,贝叶斯进化分析抽样树(BEAST)软件包做进化分析,用Datamonkey在线软件包进化的混合效应模型(MEME)方法对IDUs分离的序列做选择压力分析,用进化分析软件Arlequin的Tajima和Fu中性检验分析种群扩张情况。结果 本组IDUs不同亚型内部同源性比较结果为:HCV-3b同源性最高(97%),其次为HCV-3a(96%),HCV-6a(95%)和HCV-1b(94%);HCV进化速率分析显示:HCV-1b的进化速率最快2.17E-03替换数/位点/年(y/y/y)],其次为HCV-3b(2.12E-03 y/y/y),HCV-3a(1.58E-03 y/y/y)和HCV-6a(1.28E-03 y/y/y); HCV理论感染人数分析:19...
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关 键 词: | 丙型肝炎病毒 HCV进化 HCV选择压力 注射吸毒者 正向选择位点 直接抗病毒药物 广东 |
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