| 茉莉酸甲酯诱导下远志幼苗转录组分析及三萜类生物合成途径关键酶基因挖掘 |
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| 引用本文： | 彭亮,颜永刚,陈莹,沈霞,高静,李依民,张岗,张明英,胡本祥,杨冰月,孙静. 茉莉酸甲酯诱导下远志幼苗转录组分析及三萜类生物合成途径关键酶基因挖掘[J]. 中草药, 2020, 51(9): 2517-2529 |
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| 作者姓名： | 彭亮 颜永刚 陈莹 沈霞 高静 李依民 张岗 张明英 胡本祥 杨冰月 孙静 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046 |
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| 基金项目： | 公益性行业（中医药）科研专项经费项目（201507002-1-08）；陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发学科创新团队项目（2019-QN01）；2019年医疗服务与保障能力提升补助资金（中医药事业传承与发展部分）“全国中药资源普查项目”（财社[2019]39号) |
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| 摘 要： | 目的获得远志Polygala tenuifolia响应茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)处理的转录组学信息,挖掘远志三萜类化合物骨架生物合成的关键酶基因。方法以生长30 d的远志组培苗为材料,分别用无菌水(CK)、50μmol/L MeJA、100μmol/LMeJA处理24h,采用Illunima HiseqTM2000 150PE进行转录组测序,使用Trinity软件完成Unigene的denovo拼接,基于BLAST实现Unigene的分类、功能注释、代谢通路分析、蛋白功能注释、差异基因分析和筛选等。结果最终获得52.19 Gb数据,通过de novo拼接注释得到Unigene 54 426条,平均长度为1 604 bp,注释成功率100%。通过对MeJA处理前后基因进行差异分析,共筛选出差异基因3 390个,其中有1 287个上调,2 103个下调,且以100μmol/L MeJA处理的差异基因总数及上调数最高。KEGG富集分析表明,差异基因主要富集于苯丙烷类生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢、淀粉蔗糖代谢、光合生物的固碳作用、萜类骨架生...
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| 关 键 词： | 远志 转录组 茉莉酸甲酯 三萜类 Unigene |
| 收稿时间： | 2020-01-06 |
Transcriptome analysis of Polygala tenuifolia seedlings induced by methyl jasmonate and key genes mining for triterpenoid biosynthetic pathway |
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| PENG Liang,YAN Yong-gang,CHEN Ying,SHEN Xi,GAO Jing,LI Yi-min,ZHANG Gang,ZHANG Ming-ying,HU Ben-xiang,YANG Bing-yue,SUN Jing. Transcriptome analysis of Polygala tenuifolia seedlings induced by methyl jasmonate and key genes mining for triterpenoid biosynthetic pathway[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2020, 51(9): 2517-2529 |
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| Authors: | PENG Liang YAN Yong-gang CHEN Ying SHEN Xi GAO Jing LI Yi-min ZHANG Gang ZHANG Ming-ying HU Ben-xiang YANG Bing-yue SUN Jing |
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| Affiliation: | Shaanxi Qinling Application Development and Engineerig Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Polygala tenuifolia Willd. transcritome methyl jasmonate triterpenoid Unigene |
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