| 基于高通量分子对接虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶中药小分子抑制剂及抗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的中药及其复方预测 |
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| 引用本文： | 马青云,刘辰,杜海涛,张贵晟,闫滨,孙启慧,刘孝云,齐冬梅,杨勇,容蓉.基于高通量分子对接虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶中药小分子抑制剂及抗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的中药及其复方预测[J].中草药,2020,51(6):1397-1405. |
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| 作者姓名： | 马青云 刘辰 杜海涛 张贵晟 闫滨 孙启慧 刘孝云 齐冬梅 杨勇 容蓉 |
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| 作者单位： | 山东中医药大学药学院, 山东 济南 250355;山东中医药大学理工学院, 山东 济南 250355;山东中医药大学药学院, 山东 济南 250355;山东省高校中医药抗病毒协同创新中心, 山东 济南 250355;山东中医药大学实验中心, 山东 济南 250355;山东省高校中医药抗病毒协同创新中心, 山东 济南 250355 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81873220）;国家自然科学基金资助项目（81774167）;山东省重点研发计划（2018CXGC1307） |
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| 摘 要： | 目的基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,运用计算机虚拟筛选技术寻找新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶的中药小分子抑制剂,推测潜在抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中药及中药复方。方法以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合"ADME-Lipinski"规则进行再次筛选,以优选活性成分,推测关键中药及复方。基于网络药理学角度,构建成分-靶点-通路网络,推测核心药对的作用机制。结果以SARS-Co V-2原配体为阳性对照,筛选出66个药动学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出12味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗SARS-CoV-2的候选方案。结论基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击SARS-Co V-2提供了科学指导与理论依据。
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| 关 键 词： | 分子对接 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 3CL水解酶 中药小分子抑制剂 网络药理学 甘草-桑白皮 金银花-连翘 |
| 收稿时间： | 2020/2/18 0:00:00 |
Virtual screening of small molecular inhibitors of SARS-CoV-2 3CL hydrolase based on high-throughput molecular docking and prediction of Chinese materia medica and its compound against COVID-19 |
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| MA Qing-yun,LIU Chen,DU Hai-tao,ZHANG Gui-sheng,YAN Bin,SUN Qi-hui,LIU Xiao-yun,QI Dong-mei,YANG Yong,RONG Rong.Virtual screening of small molecular inhibitors of SARS-CoV-2 3CL hydrolase based on high-throughput molecular docking and prediction of Chinese materia medica and its compound against COVID-19[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2020,51(6):1397-1405. |
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| Authors: | MA Qing-yun LIU Chen DU Hai-tao ZHANG Gui-sheng YAN Bin SUN Qi-hui LIU Xiao-yun QI Dong-mei YANG Yong RONG Rong |
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| Institution: | School of Pharmacy, Shandong University of Traditional Chinese Medicine, Jinan 250355, China;School of Technology, Shandong University of Traditional Chinese Medicine, Jinan 250355, China;School of Pharmacy, Shandong University of Traditional Chinese Medicine, Jinan 250355, China;Collaborative Innovation Center for Antiviral Traditional Chinese Medicine in Shandong Province, Jinan, 250355, China;Experimental Center, Shandong University of Traditional Chinese Medicine, Jinan 250355, China;Collaborative Innovation Center for Antiviral Traditional Chinese Medicine in Shandong Province, Jinan, 250355, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | molecular docking SARS-CoV-2 COVID-19 3CL hydrolase small molecule inhibitor of CMM network pharmacology Glycyrrhizae Radix et Rhizoma-Mori Cortex Lonicerae Japonicae Flos-Forsythiae Fructus |
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