2019年潍坊地区一株登革病毒全基因组序列分析 |
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引用本文: | 李东英,霍锡元,孙玉红,聂清,张作栋,刘淑慧.2019年潍坊地区一株登革病毒全基因组序列分析[J].中华卫生杀虫药械,2023(3):255-259. |
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作者姓名: | 李东英 霍锡元 孙玉红 聂清 张作栋 刘淑慧 |
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作者单位: | 1. 潍坊市疾病预防控制中心;2. 潍坊市人民医院 |
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摘 要: | 目的 分析2019年潍坊市一株登革病毒(Weifang 2019)全基因组序列及关键性氨基酸位点的突变情况。方法 收集登革病毒感染病例的血清样本,对初检阳性样本进行病毒分离、全基因组测序,构建进化树,对该序列进行核苷酸/氨基酸相似性分析。结果 本研究中,分别以登革病毒1型(DENV-1)参考毒株(NC_001477.1)和原型株(EU848545.1)为对照,Weifang 2019核苷酸基因组的全序列分别检出94个和95个氨基酸位点突变,其中有57个突变位点一致。其中,3个结构蛋白和7个非结构蛋白均存在突变,蛋白NS5、E和NS1位点突变占比前3位。核苷酸序列和氨基酸序列分析发现Weifang2019与Guangdong 2014(99.5%/99.3%)、Wenzhou 2014(99.6%/99.4%)、Guangdong 2016(99.4%/99.2%)、Henan 2014(99.5%/99.3%)处于同一进化分支,且相似性均大于99%。结论 2019年潍坊地区一株登革病毒Weifang 2019与Guangdong 2014(MN018287.1)、Wenzhou 201...
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关 键 词: | 登革热 登革1型病毒 E氨基酸位点 关键性氨基酸 |
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