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手工与全自动核酸提取仪提取石蜡包埋组织DNA的比较
引用本文:马本婷,陈晔,沈立承,江峥增,徐一凡,黄洁,宿杰阿克苏. 手工与全自动核酸提取仪提取石蜡包埋组织DNA的比较[J]. 中国临床医学, 2020, 27(6)
作者姓名:马本婷  陈晔  沈立承  江峥增  徐一凡  黄洁  宿杰阿克苏
作者单位:复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科,复旦大学附属中山医院病理科
基金项目:上海市临床重点专科(shslczdzk01302)
摘    要:目的:比较手工与全自动核酸提取仪提取石蜡包埋组织DNA的浓度和纯度之间的差异,探讨不同提取方法、不同消化方式对DNA提取的影响。方法:选取27例中性福尔马林固定石蜡包埋组织标本,同一技师分别用手工提取与全自动核酸提取仪提取DNA的方法以及分别置于金属浴和恒温箱中消化,进行DNA提取。结果:使用金属浴对组织进行消化,手工提取DNA的浓度为107.1±30.1 ng/μL,全自动核酸提取仪提取DNA的浓度为39.1±16.5 ng/μL;使用恒温箱对组织进行消化,手工提取DNA的浓度为75.5±28.2 ng/μL,全自动核酸提取仪提取DNA的浓度为29.6±17.1 ng/μL,手工提取DNA的浓度均较高,差异有统计学意义(两者均为P<0.01)。手工提取和全自动DNA提取中,使用金属浴消化提取的DNA浓度均比使用恒温箱消化的高(107.1±30.1 VS 75.5±28.2,39.1±16.5 VS 29.6±17.1),差异有统计学意义(两者均为P<0.05)。不同提取方法及消化方式提取DNA的纯度无显著性差异。 结论:手工提取石蜡包埋组织DNA的浓度较高,使用金属浴消化组织提取DNA较恒温箱消化好,不同方式提取的DNA质量均满足分子病理检测需求。

关 键 词:手工提取DNA  全自动核酸提取仪提取DNA  金属浴  恒温箱  DNA浓度
收稿时间:2020-02-05
修稿时间:2020-04-22

Comparison of extraction of paraffin-embedded tissue DNA by manual and automatic nucleic acid extraction epparatus
ma benting,CHEN Ye,SHEN Li-cheng,JIANG Zheng-zeng,XU Yi-fan,HUANG Jie and SU Jie-a-ke-su. Comparison of extraction of paraffin-embedded tissue DNA by manual and automatic nucleic acid extraction epparatus[J]. Chinese Journal Of Clinical Medicine, 2020, 27(6)
Authors:ma benting  CHEN Ye  SHEN Li-cheng  JIANG Zheng-zeng  XU Yi-fan  HUANG Jie  SU Jie-a-ke-su
Affiliation:Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University,Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University
Abstract:
Keywords:manual extraction of DNA   automatic nucleic acid extractor extraction of DNA   metal bath   incubator   DNA concentration
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