卒中患者肠道宏病毒组的组成和菌群特征

目的探究卒中患者和健康志愿者之间肠道宏病毒组和肠道菌群的差异。方法选取2014年2月~2016年2月在南方医院神经内科就诊的急性缺血性卒中患者15名，同时招募15名年龄性别匹配的健康志愿者，对所有志愿者的粪便样本进行宏病毒组测序和16S rRNA测序，分析卒中患者和健康志愿者肠道宏病毒组和肠道菌群组成和结构的差异。结果宏病毒组测序结果显示卒中患者肠道宏病毒组的整体多样性与健康志愿者无差异（α多样性：P=0.320，β多样性：P=0.169, R²=0.037），但两者宏病毒组的组成不同，LEfSe分析提示Bacteroides phage B40_8和Cronobacter phage CS01的相对丰度在卒中患者中升高。16S rRNA测序结果显示卒中患者肠道菌群的结构和组成与健康志愿者存在显著差异（α多样性：P=0.950，β多样性：P=0.005, R²=0.117），LEfSe分析提示卒中患者中Megasphaera等菌属的相对丰度增加，而Bifidobacterium等菌属的相对丰度下降。此外，相关性分析显示在卒中患者的肠道宏病毒组中Streptococcus的噬菌体的相对丰度与其宿主呈正相关（r=0.550, P=0.036）；而在健康志愿者的肠道宏病毒组中Faecalibacterium、Bilophila和Roseburia的噬菌体的相对丰度分别与其宿主呈正相关（Faecalibacterium: r=0.520, P=0.049; Bilophila: r=0.541, P=0.040; Roseburia: r=0.526, P=0.046）。结论卒中患者肠道宏病毒组的整体多样性与健康志愿者相似，但宏病毒组的组成及其与菌群的相互作用模式不同；卒中患者肠道菌群的结构与健康志愿者存在差异，机会致病菌的相对丰度在卒中患者中升高，但共生菌的相对丰度降低。