药用植物生物信息数据库及生产布局可视化分析平台(以川产道地药材为例) |
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作者姓名: | 华桦 田韦韦 马炅妤 王云峰 王亚强 严志祥 赵军宁 |
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作者单位: | 1. 四川省中医药转化医学中心四川省中医药科学院国家中医药管理局中药质量生物学评价重点研究室中医药转化医学四川省重点实验室四川省道地药材系统开发工程技术研究中心四川省道地药材形成原理与品质评价工程研究中心;2. 自然资源部第三地理信息制图院数字城市工程中心;3. 中国科学院微电子研究所数字健康芯片与系统实验室;4. 成都信息工程大学软件工程学院;5. 国家药品监督管理局药品监管科学全国重点实验室 |
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基金项目: | 四川省科技支撑计划项目(2013SZ0115);;四川省中医药管理局2017年科技专项(2017C008);;四川省中医药管理局2016年科技专项(2016Z011); |
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摘 要: | 目前对药用植物的研究和认识已进入到跨组学、跨学科智能新阶段,迫切需要将这些大数据进行整合并交互应用,形成统一、多层次的研究体系和大数据平台。道地药材作为一类重要的药用植物来源,是中医药特有的品质优劣概念和综合判别标准。国内外已建立中医药百科全书数据库(ETCM)、全球药典基因组数据库(GPGD)等为代表的数据库平台,但未能及时反映新近的大量地理资源、表型、化学成分和遗传信息等多维度数据。四川省是著名的“中医之乡,中药之库”,据四川省第四次全国中药资源普最新统计中药品种数超过8 000种,川产道地药材品种86种,是我国药用植物多样性最具代表性的地区。该文基于四川省第四次全国中药资源普查最新数据及相关成果,以川产道地药材为例构建药用植物生物信息数据库及生产布局可视化分析平台,涵盖了地理资源数据、表型数据、化学成分数据和遗传资源数据等,有效地将川产道地药材多维度数据统一整合,并提供不同层面的数据交互应用。该平台不仅是首个针对川产道地药材的大型多维数据库和可视化平台,可为川产道地药材种质资源鉴定、药效成分生物合成途径解析、优良品种分子育种等奠定基础。该平台提供的以川产道地药材为代表的药用植物资...
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关 键 词: | 药用植物 川产道地药材 生产布局 生物信息 数据化 可视化 |
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