带TRS基序突变的新型冠状病毒威胁更大

目的研究冠状病毒转录调控序列（TRS）基序突变，为深入研究冠状病毒的爆发、传播规律以及开发减毒活疫苗等提供理论基础。方法采用进化与分子功能联合分析法，对公开的全部套目病毒基因组数据进行分析。结果冠状病毒基因组内的前导转录调控序列（TRS-L）通常由其5''端非编码区内的前60~70个核苷酸残基组成，长度不同的基因体转录调控序列（TRS-B）位于除ORF1a和1b外的其它基因紧邻的上游，每个冠状病毒基因组的TRS-L和TRS-B共有一段特定的一致性序列，即TRS基序，TRS基序中出现的碱基变化叫做TRS基序突变。TRS基序突变如果发生在TRS-L或多个TRS-B中，会形成超级减毒株。超级减毒株的扩散，可引起无症或轻症感染者增多，潜伏时间长，以及漏检率上升等问题，对SARS-CoV-2的防控提出新的挑战。超级减毒株还会增大与人类长期共存的概率，将长期威胁人类健康。Delta突变株与此前出现的突变株有显著不同，如果不高度重视，可能引起大规模传播。带TRS基序突变的Delta突变株已经在新加坡出现并有扩散趋势，因此新加坡，甚至东南亚可能形成下一波疫情的传播中心。结论各种SARS-CoV-2突变株都将产生TRS基序突变，只有带TRS基序突变的超级减毒株，才能最终失去跨物种传播和大爆发的能力。