| 分子遗传学数据分析和处理平台的设计与实现 |
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| 引用本文： | 闫微,郭云波,王胜军,刘娜,邓亲恺. 分子遗传学数据分析和处理平台的设计与实现[J]. 热带医学杂志, 2008, 8(3): 225-228 |
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| 作者姓名： | 闫微 郭云波 王胜军 刘娜 邓亲恺 |
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| 作者单位： | 南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515;南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515;南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515;南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515;南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515 |
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| 摘 要： | 目的 开发一个在高性能计算机的Linux环境下运行,基于B/S模式的分子遗传学数据分析与处理平台.方法 以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言整合许多遗传学数据分析软件和工具包,针对不同的SNPs变异数据,以提示方式简化数据输入格式和参数设置,经平台处理的结果以表格、文本或图像格式输出.结果 该平台实现了连锁不平衡的计算和绘制、挑选标签SNP和疾病对照设计或传递不平衡设计的关联分析,以及对一些群体遗传数据的估计等功能,操作简单,数据分析速度快.结论 该平台作为一个整合的遗传学研究辅助工具,克服了当前遗传分析软件或工具包在操作使用方面的不足,为遗传学研究者提供方便.目前该平台正处于测试阶级,运行状态良好.
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| 关 键 词： | SNPs 遗传变异 关联分析 群体遗传 生物信息学 |
| 文章编号： | 1672-3619(2008)03-0225-04 |
| 修稿时间： | 2007-10-12 |
The Design of Data Analysis and Processing Platform for Molecular Genetics |
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| YAN Wei,GUO Yun-bo,WANG Sheng-jun,LIU Na,DENG Qin-kai. The Design of Data Analysis and Processing Platform for Molecular Genetics[J]. Journal Of Tropical Medicine, 2008, 8(3): 225-228 |
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| Authors: | YAN Wei GUO Yun-bo WANG Sheng-jun LIU Na DENG Qin-kai |
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