肺腺癌关键基因筛选及CDC20在肺腺癌中的表达及预后分析 |
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引用本文: | 周春雷,韩菲,樊祥山. 肺腺癌关键基因筛选及CDC20在肺腺癌中的表达及预后分析[J]. 南京医科大学学报(自然科学版), 2020, 0(1) |
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作者姓名: | 周春雷 韩菲 樊祥山 |
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作者单位: | 南京大学医学院附属鼓楼医院病理科,南京医科大学附属儿童医院,南京大学医学院附属鼓楼医院病理科 |
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基金项目: | 南京医科大学科技发展基金(NMUB2018086) |
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摘 要: | 目的:肺腺癌的发生发展是一个多因素、多基因参与的过程。本研究的目标是筛选出肺腺癌的关键基因,揭示肺腺癌潜在的分子机制。方法:本研究利用三个肺腺癌相关基因芯片数据集,共包括156例肺腺癌和106例正常肺组织,进行肺腺癌潜在关键基因的筛选。结果:首先,通过芯片数据分析得到341个重叠差异基因,差异基因主要富集的生物学过程是细胞外基质组织、调控化学激酶介导的信号通路、细胞对转化生长因子刺激的反应、细胞外基质组装、调控新生血管生成等。然后,通过PPI(Protein Protein Interaction )蛋白互作网络筛选出10个关键基因,其中8个基因AURKA( Aurora Kinase A)、CDC20(Cell Division Cycle 20)、CDH5(Cadherin 5)、COL1α1(Collagen I,α1)、EDN1(Endothelin 1)、MMP9(Matrix Metalloprotein 9)、PECAM1(Platelet Endothelial Cell Adhesion Molecule 1)、SPP1(Secreted Phosphoprotein 1)与肺腺癌预后相关。其中CDC20与肺腺癌预后相关性最高,在亚组分析中发现:CDC20在肺腺癌患者中随着年龄的增加表达逐步增加,CDC20在一期肺腺癌患者中表达低于二期、三期、四期患者,CDC20在腺泡型、实性为主型、混合型、透明细胞型表达高于其他亚型,CDC20在吸烟的肺腺癌患者中的表达低于不吸烟者。进一步,我们通过免疫组化检测显示CDC20在肺腺癌组织中表达明显高于正常肺组织,且腺泡型、实体型表达高于其他亚型。结论:本研究发现CDC20的高表达与肺腺癌存在明显的相关性,且其高表达与肺腺癌的不良预后显著相关。CDC20有可能成为肺腺癌治疗的新靶点。
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关 键 词: | 肺腺癌;CDC20;Gene Expression Omnibus( GEO);关键基因;预后 |
收稿时间: | 2019-04-11 |
修稿时间: | 2019-10-08 |
Screening of key genes by Bioinformatics analysis and the expression and prognosis of CDC20 in lung adenocarcinoma |
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Abstract: | |
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Keywords: | Lung adenocarcinoma CDC20 Gene Expression Omnibus( GEO) Key genes Prognosis |
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