| LncRNA在缺氧诱导的胃癌细胞中表达谱的变化 |
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| 引用本文： | 王亚芳,刘理礼,靳海峰,张慧,张宏博,聂勇战,吴开春,樊代明. LncRNA在缺氧诱导的胃癌细胞中表达谱的变化[J]. 现代肿瘤医学, 2013, 21(2): 225-228 |
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| 作者姓名： | 王亚芳 刘理礼 靳海峰 张慧 张宏博 聂勇战 吴开春 樊代明 |
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| 作者单位： | 1. 第四军医大学附属西京医院消化科,陕西西安,710032
2. 第四军医大学附属唐都医院肿瘤科,陕西西安,710038 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)在常氧条件下的胃癌细胞及缺氧诱导的胃癌细胞中表达谱的变化。方法:利用lncRNA芯片技术检测常氧条件下的胃癌细胞,缺氧诱导的胃癌细胞中lncRNA表达谱的变异,经对原始数据进行预处理达到均一化后,筛选出差异表达lncRNA,进行分析。结果:与常氧条件下的胃癌细胞相比较,缺氧诱导胃癌细胞中1.5倍以上变化并有显著差异(P<0.05)的lncRNA,确定为差异表达lncRNA。其中在三种胃癌细胞中的变化均在1.5倍以上的共254条,占所有lncRNA的3.6%;大于1.5倍上调的共136条,1.5倍以上降低的共118条;2倍以上上调的共30条;2倍以上降低的共25条;3倍以上升高的共5条;3倍以上降低的共5条。结论:缺氧诱导的胃癌细胞与常氧的胃癌细胞比较,lncRNA表达谱发生显著变化。提示差异性表达的lncRNAs可能参与了缺氧环境下胃癌细胞多种恶性表型的变化。
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| 关 键 词： | 长链非编码RNA LncRNA芯片 胃癌 缺氧 |
Study on expression profile of long non-coding RNA in gastric cancer cell lines under hypoxia |
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| Wang Yafang , Liu Lili , Jin Haifeng , Zhang Hui , Zhang Hongbo , Nie Yongzhan , Wu Kaichun , Fan Daiming. Study on expression profile of long non-coding RNA in gastric cancer cell lines under hypoxia[J]. Journal of Modern Oncology, 2013, 21(2): 225-228 |
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| Authors: | Wang Yafang Liu Lili Jin Haifeng Zhang Hui Zhang Hongbo Nie Yongzhan Wu Kaichun Fan Daiming |
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| Affiliation: | 1State Key Laboratory of Cancer Biology & Xijing Hospital of Digestive Diseases,the Forth Military Medical University,Shaanxi Xi’an 710032,China;2Department of Oncology,Tangdu Hospital,the Forth Military Medical University,Shaanxi Xi’an 710038,China. |
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| Abstract: | |
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