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基于CRISPR/Cas13a技术检测肿瘤驱动基因TP53R248W的研究
引用本文:邝振展,肖斌,孙朝晖,罗镕,何洁雯,李林海. 基于CRISPR/Cas13a技术检测肿瘤驱动基因TP53R248W的研究[J]. 南京医科大学学报(自然科学版), 2022, 42(8): 1119-1124
作者姓名:邝振展  肖斌  孙朝晖  罗镕  何洁雯  李林海
作者单位:中国人民解放军南部战区总医院检验科,广东 广州 510010;广州医科大学附属第六医院(清远市人民医院)检验医学部,广东 清远 511518;广州医科大学金域检验学院,广东 广州 510180;广州南方学院云康医学与健康学院,广东 广州 510970
基金项目:全军保健专项科研课题(18BJZ4);广东省医学科学技术研究基金项目(B2019139);全军卫勤保障能力创新与生成项目(20WQO29);后勤科研开放项目(BLB19J009)
摘    要:目的:建立一种基于 CRISPR/Cas13a 的 TP53 R248W 变异体的快速检测技术。方法:根据 Over?lap PCR 技术,以 TP53野生型质粒为模板构建TP53 R248W变异体质粒;对TP53R248W变异体扩增产物大小,扩增反应条件及crRNA长度和浓度进行优化,初步建立基于CRISPR/Cas13a的R248W变异体快速检测方法;利用不同突变率TP53 R248W变异体及模拟血浆 ctDNA,评价 CRISPR/Cas13a 方法的检测灵敏度。结果:建立的 CRISPR/Cas13a 方法成功检测出产物大小为 368 bp 的 TP53 R248W片段;在0.05~0.25 μmol/L浓度范围内,crRNA浓度越高,检测结果相对荧光值越高;该方法检测TP53 R248W变异体的灵敏度为1×104 拷贝/μL,最低可以检测出突变率为0.01%的变异体。结论:建立的CRISPR/Cas13a方法具有快速、简便、灵敏、 特异等优点,为组织和血浆中的TP53 R248W变异体的检测提供了新的技术手段。

关 键 词:CRISPR/Cas13a  TP53 R248W  crRNA  快速检测

Detection of tumor driver gene TP53 R248W by CRISPR/Cas13a
KUANG Zhenzhan,XIAO Bin,SUN Zhaohui,LUO Rong,HE Jiewen,LI Linhai. Detection of tumor driver gene TP53 R248W by CRISPR/Cas13a[J]. Acta Universitatis Medicinalis Nanjing, 2022, 42(8): 1119-1124
Authors:KUANG Zhenzhan  XIAO Bin  SUN Zhaohui  LUO Rong  HE Jiewen  LI Linhai
Abstract:
Keywords:
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