皮肌炎差异表达基因鉴定及治疗药物预测

目的 探讨皮肌炎(DM)可能的发病机制、潜在治疗靶点及药物。方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载符合筛选标准的健康人群和DM患者的芯片信息。利用R语言相关软件包筛选差异表达基因(DEGs);分析DEGs的基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集情况。利用STRING在线数据库及Cytoscape软件构建蛋白质互作网络，并筛选出关键基因加以验证。基于CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润情况，分析核心基因表达量与免疫细胞丰度的相关性。利用DREIMT在线分析工具和Coremine Medical数据库预测潜在治疗DM疾病的药物。结果 与健康人群相比，DM患者肌肉组织中上调的DEGs为402个，下调的DEGs为150个，皮肤组织中上调的DEGs为686个，下调的DEGs为284个，肌肉和皮肤共有的DEGs为170个。GO、KEGG富集分析结果显示，上述DEGs主要富集于固有免疫应答、对病毒的防御反应、细胞质、细胞质膜等条目，富集于新型冠状病毒感染疾病、甲型流感、麻疹、丙型肝炎等通路。共筛选出10个核心基因，分别为STAT1、MX1、IFIT3、OAS2、I...