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线粒体自噬相关基因在胃腺癌中的差异表达与核心基因挖掘
作者姓名:熊华朝  严明权  肖炜明  张思琴
作者单位:1. 扬州大学医学院;2. 扬州大学附属医院消化内科
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81873866);
摘    要:目的 探讨线粒体自噬相关基因(MRGs)在胃腺癌(STAD)中的差异表达并挖掘核心基因。方法 从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得STAD患者的临床样本信息,基于基因集富集分析(GSEA)网站和基因卡片(GeneCards)数据库获取有统计学意义的MRGs共26个;基于最小绝对值收缩与选择算子(LASSO)回归构建MRGs在STAD中的预后模型,筛选出线粒体自噬预后相关基因(MPRGs)。通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,获得关键基因参与的生物学过程和通路;利用STRING数据库构建MPRGs的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并应用Cytoscape软件进行可视化。结果 基于LASSO回归构建的预后模型中共筛选出15个MPRGs,即ATG12、CSNK2A2、CSNK2B、FUNDC1、MAP1LC3A、MAP1LC3B、PGAM5、PINK1、SQSTM1、TOMM20、TOMM22、TOMM40、TOMM5、UBA52、UBC,均为STAD的危险因素;15个MPRGs中,UBC、UBA52基因对STAD的进展...

关 键 词:胃腺癌  生物信息学分析  枢纽基因  差异表达基因  线粒体自噬  信号通路  生物学过程
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