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基于网络药理学与分子对接探讨藤梨根治疗胃癌的作用机制
引用本文:王维强,郝民琦,叶晓莹,罗敏,高卓维.基于网络药理学与分子对接探讨藤梨根治疗胃癌的作用机制[J].现代消化及介入诊疗,2023(1):28-33+40.
作者姓名:王维强  郝民琦  叶晓莹  罗敏  高卓维
作者单位:1. 广州中医药大学顺德医院肿瘤中心;2. 南方医科大学中西医结合医院肝病科;3. 南方医科大学南方医院检验科;4. 南方医科大学第三附属医院中医科
基金项目:广东省自然科学基金(2019A1515011275、2022A1515011284、2019A1515110416);
摘    要:目的 通过数据库挖掘藤梨根治疗胃癌的作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选药物活性成分及作用靶点,结合Gene Cards、OMIM、PharmGKB、DrugBank以及TTD数据库中的胃癌相关靶点,构建“药物-化合物-交集靶点”网络,并对交集靶点进行蛋白网络互作(PPI)运算及功能分析以进一步得出藤梨根治疗胃癌的核心基因。最后使用Autodock软件对藤梨根活性成分及核心基因进行分子对接。结果 经分析发现,藤梨根有效化合物共6个,对应靶点468个;胃癌靶点12117个,与藤梨根中5个化合物取得交集靶点共148个,其中核心基因13个。GO功能分析结果示,生物过程涉及细胞对化学应激的反应、金属离子响应、脂多糖反应等,KEGG富集分析主要涉及PI3K-AKT信号通路、炎症相关信号通路(TNF、IL17A)、肿瘤相关信号通路等。分子对接结果显示藤梨根其主要活性成分与核心靶点结合能均<-5 kcal/mol,能够自发结合,其中具有较强结合活性(结合能≤-7 kcal/mol)成分靶点占82.8%以上。结论 藤梨根的活性成分可能主要通过调控PI3K-Akt、TNF等信号通路,作用于AK...

关 键 词:藤梨根  胃癌  网络药理学  分子对接  作用机制
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