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鼠源抑癌新基因 Ndr2的克隆、测序与生物信息学分析
作者姓名:Yang XL  Zhang YL  Yao LB  Liu XP  Ji SP  Xing FY
作者单位:1. 第四军医大学生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710032
2. 第一军医大学附属南方医院消化病研究所,广东,广州,510515
3. 第一军医大学全军微循环重点实验室,广东,广州,510515
基金项目:国家自然科学基金,39825113,
摘    要:背景与目的:人源Ndr2(N-myc down-stream regulator2)基因是本室于1999年从正常人全脑cDNA文库中克隆到的一个新基因GenBank,AF159092]。初步实验表明,Ndr2有可能是一个抑癌基因,为进一步研究该基因的功能,我们拟克隆小鼠的Ndr2的基因组序列。方法:以小鼠的基因组文库为模板,采用RT-PCR方法扩增Ndr2的基因组片段,用310Genetic Analyzer自动测序仪测序,GenBankBLAST相似性分析其与人源Ndr2基因同源性,PcGene和ORF Finder作读框分析。ProDom软件作结构域分析。结果:经琼脂糖DNA电泳鉴定,获得一约3310bp大小的特异条带,并克隆入pMD18-T载体,BLAST相似性分析结果表明该序列与人源Ndr2基因高度同源(同源性为91.4%)。瑕鼠基因组数据库无同源性,已公布的鼠源Ndr2mRNA序列比较发现该基因有8个外显子,7个内含子,读框分析表明,该序列编码含200个氨基酸的蛋白质,ProDom软件分析发现其含有酰基携带蛋白(ACP)样结构域。结论:本研究克隆了一个鼠的Ndr2基因并已测序。该基因为一新基因,该序列已被GenBank收录(登录号:AY151387)。

关 键 词:基因  Ndr2  克隆  生物信息学
文章编号:1000-467X(2003)03-0230-05
修稿时间:2002年12月29

Cloning,sequencing and bioinformatics analysis of a new tumor suppressor gene ndr2 from mouse
Yang XL,Zhang YL,Yao LB,Liu XP,Ji SP,Xing FY.Cloning,sequencing and bioinformatics analysis of a new tumor suppressor gene ndr2 from mouse[J].Chinese Journal of Cancer,2003,22(3):230-234.
Authors:Yang Xing-Long  Zhang Ya-Li  Yao Li-Bo  Liu Xin-Ping  Ji Shao-Ping  Xing Fei-Yue
Institution:Department of Biochemistry and Molecular Biology, The Fourth Military Medical University, Xi'an, Shanxi, 710032, P.R.China.
Abstract:
Keywords:Gene  Ndr2  Clone  Bioinformatics    
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 PubMed 等数据库收录!
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