| 安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析 |
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| 引用本文： | 晏开力,赵月萍,陈晓琴,周淑洁,陈霞,刘丹青,沈永刚,任军. 安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析[J]. 疾病控制杂志, 2009, 13(5): 516-519 |
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| 作者姓名： | 晏开力 赵月萍 陈晓琴 周淑洁 陈霞 刘丹青 沈永刚 任军 |
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| 摘 要： | 目的阐述引起安徽省2008年手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）流行的肠道病毒71型（enterovirus71,EV71）基因特征。方法采集HFMD暴发初期患者标本,进行病毒分离、培养,通过逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）鉴定上述培养物。扩增病毒株及核酸样本的VP1编码区全基因,并进行序列测定和分析。结果暴发初期分离出3份病毒株,经中和试验及RT-PCR证实为EV71。根据VP1全基因序列与EV71基因型、亚型参考株构建亲缘性关系树,17份测序结果与C4亚型聚为一簇,与A、B、C1、C2、C3、C4基因型别（亚型）的核苷酸的同源性分别为：82.0%-83.0%、84.3%-85.4%、89.7%-91.1%、89.1%-90.7%、88.3%-89.8%、93.0%-94.6%;氨基酸的同源性分别为：93.9%-95.2%、96.6%-97.6%、97.9%-98.6%、98.6%-99.3%、98.3%-98.9%、98.6%-99.6%;簇内比较显示,1株2006年的EV71毒株与另16份2008年样本在C4亚型内又分属两个亚簇,核苷酸、氨基酸的同源性分别为：96.2%-96.9%、98.3%-99.3%。结论引起安徽省2008年HFMD的EV71为C4亚型,与2006年分离的1份毒株有差异,提示安徽省存在C4亚型的不同分支。
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| 关 键 词： | 手足口病 肠道病毒A型,人 基因型 |
Genetic characterization of VP1 region of enterovirus 71 in Anhui Province |
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| YAN Kai-li,ZHAO Yue-ping,CHEN Xiao-qin,ZHOU Shu-jie,CHEN Xia,LIU Dan-qing,SHEN Yong-gang,REN Jun. Genetic characterization of VP1 region of enterovirus 71 in Anhui Province[J]. Chinese Journal of Disease Control and Prevention, 2009, 13(5): 516-519 |
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| Authors: | YAN Kai-li ZHAO Yue-ping CHEN Xiao-qin ZHOU Shu-jie CHEN Xia LIU Dan-qing SHEN Yong-gang REN Jun |
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| Affiliation: | (Anhui Center for Disease Control and Prevention, Hefei 230061, Ckina) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hand, foot and mouth disease Enterovirus A, human Genotype |
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