基于DTM-PCR、MIRU-VNTR和耐药基因测序的武汉市耐多药结核分枝杆菌的分子分型

目的描述武汉市耐多药结核(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)分枝杆菌基因型分布及成簇特征。方法采用目标缺失多重PCR(Deletion-Targeted Multiplex, DTM-PCR)、24位点MIRU-VNTR(mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat typing)以及耐药基因测序方法,对武汉市149株耐多药结核分枝杆菌进行分子分型,计算Hunter-Gaston分辨指数(Hunter-Gaston discriminatory index, HGDI),成簇率以及近期感染率最小估计值。结果全部MIRU位点的累积HGDI为0.994 4。QUB11b位点的HGDI最高(0.673 8)。联合采用DTM-PCR以及MIRU-VNTR,共鉴定出111个独立基因型和11个成簇基因型(38株),成簇率为25.50%,近期感染率最小估计为18.12%。经过耐药基因测序进一步分型,各簇内共有17(44.74%)个菌株有相同的突变位点,其余21个菌株突变位点不相同。结论联合采用DTM-PCR、24位点MIRU-VNTR分型和耐药基因测序,其基因分型分辨率较高,适合于武汉地区耐多药结核分枝杆菌的基因分型。武汉市MDR-TB的发生大多由于内源性复燃引起,但仍有一定的近期传播率。