应用基因芯片技术检测大鼠急性脊髓损伤早期阶段的基因表达谱

目的 探讨急性脊髓损伤（SCI）后的特征性改变的分子机制.方法 SD大鼠9只随机分为3组：SCI8 h组（3只）、72 h组（3只）及对照组（3只）,用改良的Allen＇s撞击法建立大鼠脊髓挫伤模型,应用含有13 200条大鼠基因的cDNA表达谱基因芯片对大鼠脊髓外伤性损伤后8 h和72 h的基因表达谱变化进行分析,并用RT-PCR方法对其中12条基因的表达水平变化进行验证.C/EBPδ基因的表达水平变化采用免疫组化和原位杂交方法进行验证.结果 SCI 8 h,52个基因的表达出现显著性变化,上调基因包括转录因子、早期快反应基因、氧化应激、补体、促炎症及抗炎症反应基因等;下调基因包括离子通道、突触及囊泡相关蛋白、神经丝蛋白、细胞骨架相关蛋白和髓鞘相关糖蛋白等.SCI 72 h,44个基因的表达出现显著性变化,包括生长因子、GTP酶、癌基因及抑癌基因、泛素系统相关蛋白等,这些基因在神经元的生长/分化/存活、修复和再生等方面起重要作用.12条基因RT-PCR的验证结果与芯片的结果相符合.结论 SCI早期多种基因表达出现显著性变化,C/EBPδ是一个在损伤脊髓组织中高表达的基因,很可能是一个治疗SCI介入靶点.

Gene expression profile in acute spinal cord injury screened by cDNA microarray: experiment with rats