腺病毒与新冠病毒合并感染的宿主表达差异化基因研究 |
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引用本文: | 贾宇丽,王雅杰.腺病毒与新冠病毒合并感染的宿主表达差异化基因研究[J].标记免疫分析与临床,2022(5):726-730. |
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作者姓名: | 贾宇丽 王雅杰 |
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作者单位: | 首都医科大学附属北京地坛医院检验科 |
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基金项目: | 北京市自然科学基金重点研究专题项目(基于新型冠状病毒蛋白质组芯片的动态血清抗体变化规律和标志物研究)(编号:M21003); |
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摘 要: | 目的 探究腺病毒与新冠病毒合并感染宿主基因的表达水平改变。方法 从GEO数据库中下载GSE68004和GSE17400表达谱芯片,分别筛选了腺病毒感染者与新冠病毒感染细胞中的表达差异基因并取交集,通过GO/KEGG通路和PPI网络分析寻找其中的核心基因和生物学过程,并挖掘了hub基因的上游转录因子及表达情况。结果 18个基因在腺病毒和新冠病毒感染中的表达水平上调,并参与了I型干扰素应答、细胞因子活化、病毒复制调控等生物学过程和分子通路。PPI网络鉴定出5个核心基因:OAS1、IFIT3、RSAD2、CXCL10和XAF1。转录因子IRF1、IRF7、STAT1和STAT2在病毒感染后的表达水平明显升高。结论 表达差异化基因主要富集在干扰素应答通路,提示免疫因素在腺病毒和新冠病毒联合感染中发挥了重要作用。
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关 键 词: | 腺病毒 新冠病毒 表达差异 干扰素 |
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