| 西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学预测分析 |
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| 引用本文： | 智 鹏,张皓旻,王毅兴,迟小华,陈浩然,陈熙勐,张钧栋,李卓阳,刘格良,杨 波,叶 芳,卢学春.西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学预测分析[J].传染病信息,2021,34(2):127-132. |
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| 作者姓名： | 智 鹏 张皓旻 王毅兴 迟小华 陈浩然 陈熙勐 张钧栋 李卓阳 刘格良 杨 波 叶 芳 卢学春 |
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| 作者单位： | 030002 太原,山西医科大学管理学院;100853 北京,中国人民解放军总医院第二医学中心血液科;200120 上海,同济大学附属东方医院中医科;100088 北京,火箭军特色医学中心药剂科;100020,北京市垂杨柳医院血液科;030002 太原,山西医科大学管理学院;100853 北京,中国人民解放军总医院第二医学中心血液科 |
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| 基金项目： | 2017年度国家老年疾病临床医学研究中心招标课题;中国人民解放军总医院转化医学项目;中国人民解放军总医院2019年度保健专项科研课题;浦东新区中医治未病高峰学科;浦东新区卫健委学科带头人计划 |
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| 摘 要： | 目的 探讨西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学机制.方法 应用R语言对基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中西多福韦相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作网络分析,应用自主研发的表观精准治疗预测平台(epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed)筛选与西多福韦关联的疾病和药物.结果 检索GEO并筛选得到GSE39293数据集,差异表达分析共筛选出585个差异表达基因,其中上调差异表达基因494个,下调差异表达基因91个.基因本体论富集条目共53条,主要与干扰病毒复制、I型干扰素作用、免疫调节等有关.京都基因与基因组百科全书富集条目共244条,主要与抗病毒、抗凋亡、免疫调节、凝血系统相关信号通路等有关.蛋白互作网络分析筛选出CDK1、CCNA2、CDC6、KIF11、MAD2L1、NDC80、RRM2、ASPM、NCAPG、CENPU为排名前10位的核心基因.EpiMed预测西多福韦调控的基因组表达谱与肺炎、严重急性呼吸综合征等疾病呈负相关,与利巴韦林、α-干扰素等药物呈正相关,与衣霉素、诺氟沙星等抗生素呈负相关.结论 西多福韦能够对机体全基因组产生影响,可能通过诱导感染细胞凋亡降低体内严重急性呼吸综合征冠状病毒-2数量,通过免疫调节、凝血系统相关信号通路等对机体免疫失调及重型患者出现的凝血功能异常进行调节,达到治疗新型冠状病毒肺炎的作用.
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| 关 键 词： | 西多福韦 新型冠状病毒肺炎 生物信息学 基因表达谱 表观精准治疗预测平台 |
Omics prediction analysis of COVID-19 treatment with cidofovir |
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| ZHI Peng,ZHANG Hao-min,Wang Yi-xing,CHI Xiao-hua,CHEN Hao-ran,CHEN Xi-meng,ZHANG Jun-dong,LI Zhuo-yang,LIU Ge-liang,YANG Bo,YE Fang,LU Xue-chun.Omics prediction analysis of COVID-19 treatment with cidofovir[J].Infectious Disease Information,2021,34(2):127-132. |
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| Authors: | ZHI Peng ZHANG Hao-min Wang Yi-xing CHI Xiao-hua CHEN Hao-ran CHEN Xi-meng ZHANG Jun-dong LI Zhuo-yang LIU Ge-liang YANG Bo YE Fang LU Xue-chun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cidofovir COVID-19 bioinformatics gene expression profile EpiMed |
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