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| 人类群体遗传结构的图论主成分分析方法 | |
| 引用本文： | 薛付忠,王洁贞,郭亦寿,胡平,王振光. 人类群体遗传结构的图论主成分分析方法[J]. 中国卫生统计, 2006, 23(1): 19-23 |
| 作者姓名： | 薛付忠 王洁贞 郭亦寿 胡平 王振光 |
| 作者单位： | 1. 山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所,250012 2. 山东大学医学院医学遗传学研究所,250012 3. 山东大学第二医院,250033 |
| 摘 要： | 目的 提出基因频率矩阵的图论主成分分析方法，探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法 从分析基因频率矩阵的结构特征入手，将主成分分析与图论中的最小生成树有机结合，构建人类群体遗传结构的图论主成分模型，并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例，验证图论主成分分析的科学性和适用性。结果 图论主成分分析的基本步骤可概括为：①对中心化基因频率的协方差矩阵进行主成分分析；②按图论原理求过”t维空间”个点的最小生成树；③利用求“颈”法分割最小生成树；④将最小生成树整合到二维主成分散点图中构建图论主成分分类图。根据此步骤，对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论主成分分析，分析结果符合中华民族源与流的客观规律。结论 图论主成分分类图既可显示各群体的遗传结构特性，又可利用最小生成树的链接关系揭示各群体间的内在联系；图论主成分分析是分析人类群体遗传结构的一种较好方法。 |
| 关 键 词： | 人类群体遗传结构 图论主成分分析 |
The Methodology of Graph Theory Principle Components Analysis on Human Population Genetic Structure |
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| Xue Fuzhong, Wang Jiezhen, Guo Yishou,et al.. The Methodology of Graph Theory Principle Components Analysis on Human Population Genetic Structure[J]. Chinese Journal of Health Statistics, 2006, 23(1): 19-23 | |
| Authors: | Xue Fuzhong Wang Jiezhen Guo Yishou et al. |
| Affiliation: | Deptment of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Shandong University (250012 |
| Abstract: | |
| Keywords: | HLA-A |
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