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判别分析驱动的微阵列数据的降维策略
引用本文:荀鹏程,钱国华,富春枫,于浩,陈峰. 判别分析驱动的微阵列数据的降维策略[J]. 中国卫生统计, 2009, 26(2)
作者姓名:荀鹏程  钱国华  富春枫  于浩  陈峰
作者单位:1. 南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,210029
2. 昆山市卫生监督所,215300
3. 上海日新医药发展有限公司,200030
基金项目:高等学校博士学科点专项科研基金,江苏省高校研究生科研创新计划项目 
摘    要:目的 探究判别分析驱动的微阵列数据之降维策略.方法 3步降维策略.即首先采用"单变量检验FDR控制"结合"相关矩阵差值综合评分法"的预选维;其次采用PCA、PLS等方法作进一步降维;最后用逐步判别的思想筛选.结果 以Alon等的结肠癌数据为例展示了该3步降维策略在判别分析过程中的应用,组内回代错误率为9.68%,弃一法交叉验证的错误率为11.29%.结论 本文提出的"初步选维→进一步降维→逐步判别筛选"的3步降维策略对于后续的微阵列数据判别分析是实用、可行的.

关 键 词:降维策略  判别分析  微阵列数据  FDR基因得分

Strategy of Dimension Reduction Driven by Discriminate Analysis for Microarray Data
Abstract:
Keywords:
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