判别分析驱动的微阵列数据的降维策略 |
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引用本文: | 荀鹏程,钱国华,富春枫,于浩,陈峰. 判别分析驱动的微阵列数据的降维策略[J]. 中国卫生统计, 2009, 26(2) |
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作者姓名: | 荀鹏程 钱国华 富春枫 于浩 陈峰 |
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作者单位: | 1. 南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,210029 2. 昆山市卫生监督所,215300 3. 上海日新医药发展有限公司,200030 |
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基金项目: | 高等学校博士学科点专项科研基金,江苏省高校研究生科研创新计划项目 |
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摘 要: | 目的 探究判别分析驱动的微阵列数据之降维策略.方法 3步降维策略.即首先采用"单变量检验FDR控制"结合"相关矩阵差值综合评分法"的预选维;其次采用PCA、PLS等方法作进一步降维;最后用逐步判别的思想筛选.结果 以Alon等的结肠癌数据为例展示了该3步降维策略在判别分析过程中的应用,组内回代错误率为9.68%,弃一法交叉验证的错误率为11.29%.结论 本文提出的"初步选维→进一步降维→逐步判别筛选"的3步降维策略对于后续的微阵列数据判别分析是实用、可行的.
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关 键 词: | 降维策略 判别分析 微阵列数据 FDR基因得分 |
Strategy of Dimension Reduction Driven by Discriminate Analysis for Microarray Data |
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Abstract: | |
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