| 枯草芽孢杆菌JLGA?SD?28转化人参皂苷Rb1的特性及其全基因组测序分析 |
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| 引用本文： | 赵彩秀,王楠,黄鑫,越皓,郭云龙,刘淑莹.枯草芽孢杆菌JLGA?SD?28转化人参皂苷Rb1的特性及其全基因组测序分析[J].中成药,2021(2):518-523. |
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| 作者姓名： | 赵彩秀 王楠 黄鑫 越皓 郭云龙 刘淑莹 |
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| 作者单位： | 长春中医药大学;中国科学院长春应用化学研究所 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(NO.2017YFC1702105)。 |
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| 摘 要： | 目的对枯草芽孢杆菌JLGA?SD?28转化人参皂苷Rb1的特性及其全基因组测序进行分析。方法利用ONT测序平台以及Nanopore测序平台进行全基因组测序鉴定该菌的特征,并对该菌进行了GO、COG以及CAZy功能注释分析。结果该菌株基因组全长为4215536 bp,GC含量为43.51%,预测编码了4229个开放阅读框(ORFs);GO分析的功能细分为43类,COG分析的功能细分为25类,CAZy分析该菌有108个与人参皂苷转化相关的基因。结论枯草芽孢杆菌JLGA?SD?28全基因组测序结果可为今后进一步研究该菌种对人参皂苷的转化提供依据。
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| 关 键 词： | 微生物转化 土壤 稀有人参皂苷 高分辨质谱 全基因组测序 |
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