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miR⁃135b⁃5p在口腔鳞状细胞癌中的表达及相关生物信息学分析
作者姓名:赵格  黎昌学  郭超  朱慧
作者单位:石河子大学医学院第一附属医院口腔科
基金项目:国家自然科学基金地区项目(81560442);自治区研究生科研创新项目(XJ2020G102);石河子大学自然科学项目(ZZZC201962A)。
摘    要:目的探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamouscellcarcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析。方法通过肿瘤与癌症基因图谱(the CancerGenomeAtlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene ExpressionOmnibus,GEO)数据库分析miR?135b?5p在OSCC组织和癌旁组织中的表达并分析其临床意义;临床收集新鲜组织标本,采用实时荧光定量PCR验证不同组织中miR?135b?5p的表达情况。采用生物信息学方法预测miR?135b?5p的靶基因并进行通路富集分析。构建蛋白互作网络筛选关键靶基因。结果OSCC组织中miR?135b?5p表达量较癌旁组织上调,差异有统计学意义(P<0.001);miR?135b?5p表达量对OSCC组织具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P<0.001);OSCC组织中miR?135b?5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);生信分析结果显示,miR?135b?5p的靶基因富集在与肿瘤相关的钙离子、cGMP?PKG、cAMP信号通路中;筛选得到10个关键靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、SNTA1、CACNA1D、SPTBN4。结论miR?135b?5p可作为一种促癌基因参与OSCC的发生发展,并具有成为OSCC诊断标志物及治疗靶点的潜在应用价值。

关 键 词:口腔鳞状细胞癌  微小RNA  miR?135b?5p  生物信息学  癌症基因组图谱  基因表达数据库  靶基因  钙离子信号通路  肿瘤分子标志物
本文献已被 维普 等数据库收录!
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