广州与佛山地区2014年登革病毒基因型特征研究

目的对2014年广州与佛山地区登革病毒C-prM区进行基因测序,从分子水平与相关国际流行株进行同源性比较,构建系统发育树,追踪其可能输入来源。方法收集本院2014年9月-11月447例登革热疑似患者急性期血清,随机选取其中广州与佛山地区不同区域的24例标本,提取病毒RNA,RT-PCR法扩增C-prM基因,并将其克隆到p MD19T载体,测序并利用生物信息学软件进行分析。结果成功测序登革病毒11株,BLAST分析表明均为登革1型病毒(DENV-1)。系统发育树结果显示GZ2014-01等序列与2010年印度德里流行株同源性高(相似度为99.21%),GZ2014-02等序列与2013年广州流行株相近(相似度为97.64%~98.82%)。广州株GZ2014-01等和佛山株GZ2014-23属于基因型Ⅴ,而广州株GZ2014-02等和佛山株GZ2014-20属于基因型Ⅰ。结论 GZ2014-01等株可能来源于印度德里,而GZ2014-02等株可能来源于中国广州。登革病毒多基因型流行可能是造成2014年登革热大暴发的原因之一。