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| 尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白融合区的二级结构及B细胞表位的预测 | |
| 引用本文： | 曹凯,黄路,安洪,舒勇,韩智敏,黄山虎,廖翔.尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白融合区的二级结构及B细胞表位的预测[J].中国免疫学杂志,2008,24(1):11-15. |
| 作者姓名： | 曹凯 黄路 安洪 舒勇 韩智敏 黄山虎 廖翔 |
| 作者单位： | 1. 南昌大学第一附属医院骨科,南昌,330006 2. 江西省儿童医院风湿免疫科,南昌,330006 3. 重庆医科大学附属第一医院骨科,重庆,400016 |
| 摘 要： | 目的：预测尤文肉瘤EWS—FLI1蛋白融合区的二级结构及B细胞表位。方法：采用SOPM／SOPMA法、Chou—Fasman法和Karplus—Schulz法预测EWS-FLI1蛋白的二级结构；综合分析蛋白的柔性结构、亲水性、表面可及性与抗原性，通过预测数据再确定EWS—FLI1蛋白融合区的抗原表位。结果：EWS—FLI1蛋白的二级结构主要为柔性区域，位于EWS—FLI1蛋白N端5．23-30，32，36-49，62，69—100，118．123，128．132，135，137．170，173—179，183—271，276-286，291—301，317—319，328—331，346—353．396-400，407-408，426-438区段；α螺旋位于N端10—15，34，55，106—107，306—316，340—345，359—362，386，392区段；β折叠位于N端20，22，50—52，65-67，102—107，272，274，289—290，323，325-327，371-375，380-384，422-424，446—447区段；B细胞表位位于N端69-79，99—114，128—152，167．171，194-208，248—265，397-406区段，融合区B细胞表位位于N端248—265区段。结论：应用多参数预测EWS—FLI1蛋白融合区的二级结构与B细胞表位，为蛋白特征及复合表位疫苗的进一步研制奠定了基础。 |
| 关 键 词： | 尤文肉瘤 EWS-FLI1蛋白 二级结构 B细胞表位 尤文肉瘤 蛋白 合区 二级结构 细胞表位 参数预测 Ewing protein region fusion epitopes B cell secondary structure Prediction 表位疫苗 特征 应用 β折叠 α螺旋 区段 |
| 文章编号： | 1000-484X（2008）01-0011-05 |
| 收稿时间： | 2007-04-28 |
| 修稿时间： | 2007年4月28日 |
Prediction for secondary structure and B cell epitopes of fusion region in EWS-FLI1 protein of Ewing's sarcoma |
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| CAO Kai,HUANG Lu,AN Hong,SHU Yong,HAN Zhi-Min,HUANG Shan-Hu,LIAO Xiang.Prediction for secondary structure and B cell epitopes of fusion region in EWS-FLI1 protein of Ewing''''s sarcoma[J].Chinese Journal of Immunology,2008,24(1):11-15. | |
| Authors: | CAO Kai HUANG Lu AN Hong SHU Yong HAN Zhi-Min HUANG Shan-Hu LIAO Xiang |
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