Ion Torrent PGMTM测序在急性髓系白血病检测中的应用 |
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引用本文: | 阴常欣,吴福群,曹睿,江雪杰,余国攀,何涵,孟凡义.Ion Torrent PGMTM测序在急性髓系白血病检测中的应用[J].临床检验杂志,2015(5):333-336. |
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作者姓名: | 阴常欣 吴福群 曹睿 江雪杰 余国攀 何涵 孟凡义 |
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作者单位: | 南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515;南方医科大学南方医院血液科,广州 510515 |
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基金项目: | 国家临床重点专科建设项目经费资助;南方医院院长基金(2012C010)。 |
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摘 要: | 目的探讨Ion Torrent PGMTM测序平台用于急性髓系白血病(AML)患者基因突变检测的可行性。方法提取27例AML患者初次治疗前的骨髓DNA,用Ion Torrent PGMTM测序仪对50个常见的肿瘤基因热点突变区进行检测,同时用Sanger测序法检测FMS样酪氨酸激酶3(FLT3)和核仁磷蛋白1(NPM1)基因的突变情况以进行验证。结果 50个目标基因中检出17个基因共29个突变位点,单个基因有多种突变方式,以单碱基替换为主。突变频率最高的是NPM1(22.2%)和FLT3(18.5%)。用Sanger测序法验证,NPM1两种方法检测的吻合度为100%,在FLT3验证中,其中有1例Sanger测序为阳性,而Ion Torrent PGMTM检测为阴性。结论 Ion Torrent PGMTM能够在短时间内得到AML患者的基因突变谱,但其在检测长片段插入/缺失中的缺陷仍需改进。
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关 键 词: | Ion Torrent PGMTM 急性髓系白血病 基因突变 测序 |
收稿时间: | 2015/1/19 0:00:00 |
Preliminary application of Ion Torrent PGMTM sequencing technology in the diagnosis of acute myeloid leukemia |
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Abstract: | |
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Keywords: | Ion Torrent PGMTM acute myeloid leukemia gene mutation sequencing |
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