| 寡核苷酸芯片探针固定化和杂交条件的优化 |
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| 引用本文： | 潘继红,韩金祥,黄海南,黄海燕. 寡核苷酸芯片探针固定化和杂交条件的优化[J]. 临床检验杂志, 2003, 21(3): 150-152 |
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| 作者姓名： | 潘继红 韩金祥 黄海南 黄海燕 |
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| 作者单位： | 山东省医药生物技术研究中心,卫生部生物技术药物重点实验室,山东济南,250062;山东省医药生物技术研究中心,卫生部生物技术药物重点实验室,山东济南,250062;山东省医药生物技术研究中心,卫生部生物技术药物重点实验室,山东济南,250062;山东省医药生物技术研究中心,卫生部生物技术药物重点实验室,山东济南,250062 |
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| 基金项目： | 山东省重点攻关基金项目 ( 0 1110 0 10 5 ) |
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| 摘 要： | 目的 探讨寡核苷酸芯片探针固定化的方法，优化杂交条件。方法 设计spacer为poly(dT)10-20的长度为15-30mer的探针，与122-1067bp的荧光标记靶序列杂交，杂交温度选择42℃-65℃，杂交时间选择1-3h。扫描分析杂交结果，通过Quantarray定量分析软件进行定量。结果 较短的如100bp左右的靶序列，spscer为poly(dT)10、探针为20mer左右即可获得非常理想的杂交结果。较长的如750bp左右的靶序列，较短的spacer不能获得理想的杂交结果，可以选择poly(dT)15或poly(dT)20，探针应为20mer以上，25mer和30mer均能获得较好的杂交结果。1k以上的靶序列与15-30mer的探针杂交信号较弱。结论 通过优化杂交条件可以有效地提高杂交效率。
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| 关 键 词： | 基因芯片 杂交信号 荧光定量 |
| 文章编号： | 1001-764X(2003)03-0150-03 |
| 修稿时间： | 2002-10-28 |
Immobilization of oligonucleotide probe on DNA chip and optimization of hybridization conditions |
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| Pan Jihong,Han Jinxiang,Huang Hainan,Huang Haiyan. Immobilization of oligonucleotide probe on DNA chip and optimization of hybridization conditions[J]. Chinese Journal of Clinical Laboratory Science, 2003, 21(3): 150-152 |
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| Authors: | Pan Jihong Han Jinxiang Huang Hainan Huang Haiyan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | gene chip hybridization signal fluorescent quantity |
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