2015－2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征

目的分析2015 — 2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒（NPEV）的分布特征，探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹（AFP）病例监测中柯萨奇病毒B组5型（Cox B5）分离株之间的关系和变迁规律。方法选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点，每月采集监测点的污水进行浓缩富集，取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞（RD）和人喉癌上皮细胞（Hep-2）进行病毒分离。通过反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）获得VP1区序列并进行分析。结果2015 — 2018年共采集污水样本84份，共分离242株NPEV，包含19个基因型，Cox B5为比例较高的基因型，占18.18%（44/242）。 2015 — 2018年，环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链，即C3、C4和D3基因亚型。 C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型，而D3基因亚型是2016 — 2018年新出现的传播链。结论2015 — 2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO11、Cox B5、Cox B3和ECHO6。 Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象。 我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统，环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法。