| 基于生物信息学探讨低剂量镉对人类正常前列腺上皮细胞基因表达谱的影响 |
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| 引用本文： | 郭亚收,徐晓峰,李楠,孙娜,段丽芳. 基于生物信息学探讨低剂量镉对人类正常前列腺上皮细胞基因表达谱的影响[J]. 中华男科学杂志, 2019, 0(2) |
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| 作者姓名： | 郭亚收 徐晓峰 李楠 孙娜 段丽芳 |
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| 作者单位： | 咸阳市中心医院泌尿外科;陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室;陕西中医药大学病理生理学教研室 |
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| 摘 要： | 目的:分析低剂量镉作用于人正常前列腺上皮细胞后其基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白,为镉相关的前列腺癌发生机制提供新的理论依据。方法:从基因芯片公共数据库(GEO)中下载19份基因芯片数据,其中经过低剂量镉处理的前列腺上皮细胞样本9例,对照10例,利用基因云-基因大数据分析(GCBI)实验平台、GenClip 2.0、Sytoscape 3.5.1等分析软件,筛选差异表达基因,探讨差异基因的蛋白交互作用网络和生物学通路,从转录组角度阐述低剂量镉作用于正常人前列腺上皮细胞后其基因分子网络改变情况,及其可能涉及的分子生物学功能。结果:与正常前列腺上皮细胞相比,共发现差异表达基因1 050(1.92%)个,主要涉及细胞生理过程、MAPK调节、细胞内信号转导的调控、免疫效应等生物学功能。HSP90AB1、BUB3和PRKAR1A基因为蛋白网络核心节点,且表达差异有统计学意义,均与正常细胞的恶性转化有关。结论:低剂量镉作用于正常人前列腺上皮细胞后,能够导致基因改变,差异基因主要涉及细胞生理过程、MAPK调节、细胞内信号转导的调控、免疫效应等生物学过程。
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| 关 键 词： | 镉,低剂量 前列腺癌 前列腺上皮细胞 基因表达 生物信息学 |
Gene expression profiles in normal human prostate epithelial cells exposed to low-dose cadmium: A bioinformatics analysis |
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