| 斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1基因的生物信息学和表达分析 |
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| 引用本文： | 陈炳宇,何兴,夏佳敏,邹蓉,黄四洲.斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1基因的生物信息学和表达分析[J].成都医学院学报,2021,16(6):681-687. |
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| 作者姓名： | 陈炳宇 何兴 夏佳敏 邹蓉 黄四洲 |
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| 作者单位： | 成都医学院 人体解剖与组织胚胎学教研室 成都 610500;发育与再生四川省重点实验室 成都 610500;成都医学院 生物医学院 成都 610500 |
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| 摘 要： | 目的 探索斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1(shmt1)基因的生物学结构和基因表达模式.方法 利用生物信息学方法对斑马鱼shmt1的基因结构、物种间同源性、物种间进化、蛋白质二级结构和三级结构等进行分析和预测,并用整胚原位杂交技术探究斑马鱼shmt1在重要器官及胚胎早期发育中的表达.结果 斑马鱼shmt1位于3号染色体(ZDB-GENE-040426-1558)上,全长15142 bp,能编码481个氨基酸,属于天冬氨酸转氨酶(AAT)超家族,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,且斑马鱼shmt1蛋白与其他哺乳动物同源物在进化上高度保守.反转录定量PCR(RT-PCR)结果显示,斑马鱼shmt1不仅在胚胎发育的各个时期表达,而且也在成年鱼的肾脏、心脏和性腺中高表达.原位杂交结果显示,shmt1除了在卵黄多核层、鼻翼板中脑区、视顶盖和视泡等处集中表达,还在肝脏特异性表达.结论 shmt1作为一碳代谢叶酸循环中的重要蛋白,在斑马鱼发育早期的胚胎卵黄多核层、鼻翼板中脑区、视顶盖和视泡、肝脏特异性表达.该研究为今后以斑马鱼为模型动物探究shmt1基因在器官发育中的功能研究奠定基础.
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| 关 键 词： | 丝氨酸羟甲基转移酶1 斑马鱼 肝脏 代谢 |
Bioinformatics and Expression Analysis of Serine Hydroxymethyltransferase 1 Gene in Zebrafish |
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| Authors: | Chen Bingyu He Xing Xia Jiamin Zou Rong Huang Sizhou |
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