|
|||||
|
|
| HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 袁菊,郭江,成军,陶明亮,蓝贤勇,洪源,靳亚平,毛羽.HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析[J].世界华人消化杂志,2006,14(6):581-587. |
| 作者姓名： | 袁菊 郭江 成军 陶明亮 蓝贤勇 洪源 靳亚平 毛羽 |
| 作者单位： | 1. 北京地坛医院传染病研究所,北京市,100011;西北农林科技大学动物科技学院,陕西省杨陵区,712100 2. 北京地坛医院传染病研究所,北京市,100011 3. 西北农林科技大学动物科技学院,陕西省杨陵区,712100 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目,No．30371288 国家重点基础研究973项目,No．2004CB518908~~ |
| 摘 要： | 目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能．方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定,再将其亚克隆到真核表达载体 pcDNATM3．1／myc-His A,通过PCR,限制酶切分析进行鉴定,并应用生物信息学初步分析其物理化学性质、蛋白质结构域、功能及染色体定位．结果:成功从HepG2细胞提取的cDNA中扩增出p7TP2基因,编码区为495核苷酸(nt),编码产物为164氨基酸残基(aa),经核苷酸序列数据库(GenBank)同源序列的搜寻,与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性,属于未知功能新基因,并成功进行TA克隆,酶切、测序均正确,并进一步亚克隆至pcDNATM3．1／ myc-His A真核表达载体,生物信息学分析此基因位于8q24．3,Mr17 146．5,理论pI:9．26,半衰期为30 h(体外哺乳类网状细胞),属于不稳定蛋白,疏水指数较高,含有潜在的三个螺旋区域,四个β折叠,四个蛋白激酶C磷酸化位点, 一个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个N-肉豆蔻酰位点,预测可能为具有不紧密的球蛋白结构,具有信号肽及两个跨膜结构域．结论:发现了HCV p7反式调节新的靶基因, 构建了pcDNATM3．1／myc-HisA真核表达载体． |
| 关 键 词： | HCV p7蛋白 反式调节基因 克隆化 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2005-12-09 |
| 修稿时间： | 2005年12月9日 |
Cloning and bioinformatics analysis of p7TP2 gene transregulated by hepatitis C virus p7 protein |
|
| Ju Yuan,Jiang Guo,Jun Cheng,Ming-Liang Tao,Xian-Yong Lan,Yuan Hong,Ya-Ping Jin,Yu Mao.Cloning and bioinformatics analysis of p7TP2 gene transregulated by hepatitis C virus p7 protein[J].World Chinese Journal of Digestology,2006,14(6):581-587. | |
| Authors: | Ju Yuan Jiang Guo Jun Cheng Ming-Liang Tao Xian-Yong Lan Yuan Hong Ya-Ping Jin Yu Mao |
| Institution: | Ju Yuan,Jiang Guo,Jun Cheng,Ming-Liang Tao,Xian-Yong Lan,Yuan Hong,Yu Mao,Institute of Infectious Diseases,Beijing Ditan Hospital,Beijing 100011,China Ju Yuan,Ming-Liang Tao,Xian-Yong Lan,Ya-Ping Jin,College of Animal Science and Technology,Northwest A & F University,Yang Ling 712100,Shaanxi Province,China |
| Abstract: | |
| Keywords: | HCV p7 protein Transregulation Clon- ing Bioinformatics analysis |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《世界华人消化杂志》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《世界华人消化杂志》下载免费的PDF全文 | |