| 非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用 |
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| 引用本文： | 闫策,罗钟琳,丁建东.非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用[J].医学教育探索,2007(4):443-456. |
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| 作者姓名： | 闫策 罗钟琳 丁建东 |
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| 作者单位： | 复旦大学高分子科学系聚合物分子工程教育部重点实验室 上海200433 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(50533010和两个基地项目) |
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| 摘 要： | 计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段。非连续分子动力学模拟(DMD)与传统的分子动力学模拟(MD)方法有所不同,基于不连续势能和相关的模拟编程方法,运行速度大大提高。本文讨论了DMD方法的特点,总结了DMD方法的应用,重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法,最后对DMD方法的发展前景进行了展望。
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| 关 键 词： | 非连续分子动力学 计算机模拟 蛋白质折叠 大分子构象 多链体系 |
Discontinuous Molecular Dynamics Simulation and Its Applications in Macromolecular Studies |
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| YAN Ce,LUO Zhong-lin,DING Jian-dong.Discontinuous Molecular Dynamics Simulation and Its Applications in Macromolecular Studies[J].Researches in Medical Education,2007(4):443-456. |
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| Authors: | YAN Ce LUO Zhong-lin DING Jian-dong |
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| Abstract: | Computer simulations have become one of critical tools to study fundamental problems related to macromolecular conformations.Different from conventional molecular dynamics simulation,discontinuous molecular dynamics(DMD) simulation is based upon a discont |
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| Keywords: | discontinuous molecular dynamics computer simulation protein folding macromolecular conformation multi-chain system |
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