高脂血症长爪沙鼠转录组的初步检测及代谢性炎症通路的研究

目的　为了弄清饮食诱发的高脂血症长爪沙鼠模型的关键基因及代谢性炎症通路调控网络。方法 利用RNA-Seq测序技术及生物信息学技术对正常组与模型组两个RNA池进行测序和分析。结果　De novo拼接后获得有效长爪沙鼠基因47522个（即>=100bp的unigene）,大小26.9Mb，与GenBank上现在的基因比对结果表明，约82.53%的序列与基因组上的外显子序列同源;诱发高脂血症与正常动物之间共获得21,125 差异基因，其中16087个下调 ，5038个上调，总体上模型组相对于正常组存在较显著的趋势性下调关系（p<0.01）。其中与长爪沙鼠高脂血症代谢性炎症密切相关的通路有8个（p<0.01），这8个通路所表达的基因中有15个与免疫和炎症相关的基因均显著下调（p<0.01）。结论　RNA-Seq测序和生物信息技术可以作为研究高脂血症动物模型的整体基因转录情况的有力工具，本实验筛选出的关键基因和通路可作为下一步研究的候选基因或操作靶点。