单细胞RNA测序鉴定纤维化相关基因在糖尿病相关心力衰竭中的作用

研究旨在探寻糖尿病和心力衰竭之间可能存在的关联，并评估纤维化相关基因在其中发挥的作用。从GEO数据库中下载心力衰竭的单细胞测序和转录组测序数据；从CTD数据库中下载与糖尿病相关的基因；通过GO和KEGG通路富集分析寻找与糖尿病相关心力衰竭密切联系的通路；收集2017年3月—2019年3月在江苏大学附属人民医院接受治疗的心衰患者，通过实时聚合酶链反应测定关键基因的表达水平。在对数据进行标准化处理后，通过对GEO数据库的mRNA表达数据进行差异表达分析，从中获取与糖尿病相关心衰的差异表达基因。结果显示，共鉴定了206个差异表达的基因，包括94个上调的基因和112个下调的基因。同时，通过对糖尿病心力衰竭的心脏组织和非糖尿病心力衰竭患者的心脏组织进行差异表达分析，并从中获取差异表达基因。结果发现，共鉴定了265个差异表达基因，包括136个上调基因和129个下调基因。PPI网络表明，差异表达基因所编码的蛋白质彼此之间表现出强烈的内在联系。单细胞测序分析结果表明S100A8主要富集在心脏祖细胞中。最后，从之前所有的糖尿病心衰患者和非糖尿病心衰患者中随机选取5名患者进行PCR检测。结果提示糖尿病心衰...