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| 新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 高春林,刘光陵,夏正坤,邱洁,高远赋,樊忠民,伏洁,任献国,徐敏,郭锡熔. 新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析[J]. 医学研究生学报, 2011, 24(2): 117-121 |
| 作者姓名： | 高春林 刘光陵 夏正坤 邱洁 高远赋 樊忠民 伏洁 任献国 徐敏 郭锡熔 |
| 作者单位： | 1. 210002,南京,南京军区南京总医院儿科;210008,南京,南京医科大学附属南京儿童医院普外科 2. 南京军区南京总医院儿科,南京,210002 3. 南京医科大学附属南京儿童医院普外科,南京,210008 4. 南京医科大学附属南京妇幼保健院,南京,210004 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(30772364); 江苏省医学领军人才培养经费基金(LJ200624) |
| 摘 要： | 目的肥胖呈现全球流行趋势。目前,已基本证实其为一种多基因遗传病,先前研究小组筛选获得肥胖相关的新基因6次跨膜表位抗原(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)在肥胖患儿脂肪组织中差异表达,旨在进一步验证其在肥胖儿童脂肪组织中的表达,并初步探讨STEAP4的生物信息学特征。方法采用实时荧光定量PCR(Realtime-qPCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中STEAP4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、Tar-getP、TMHMM、ProtScale、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析STEAP4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、结构域及亚细胞定位等。结果 STEAP4基因是一个功能未知的基因,低表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长4454 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长1380 bp,编码459个氨基酸,预测相对分子质量51981.2,定位在胞膜,蛋白序列分析显示为6次跨膜螺旋结构,为可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析显示具有黄素蛋白跨膜成分(三铁还原酶结构域),NAD(P)结合结构域,NADP氧化还原酶(依赖辅酶F420)和血红素蛋白保守位点。结论 STEAP4基因是一低表达于肥胖患儿脂肪组织中的基因,高度提示该蛋白与肥胖及其相关的胰岛素抵抗的发生存在相关性,值得进一步研究证实。 |
| 关 键 词： | 肥胖症 STEAP 基因表达 计算生物学 |
A novel gene six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4: Expression in the adipose tissue of obese children and bioinformatic analysis |
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| GAO Chun-lin,LIU Guang-ling,XIA Zheng-kun,QIU Jie,GAO yuan-fu,FAN Zhong-min,FU Jie,REN Xian-guo,XU Min,GUO Xi-rong. A novel gene six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4: Expression in the adipose tissue of obese children and bioinformatic analysis[J]. Bulletin of Medical Postgraduate, 2011, 24(2): 117-121 | |
| Authors: | GAO Chun-lin LIU Guang-ling XIA Zheng-kun QIU Jie GAO yuan-fu FAN Zhong-min FU Jie REN Xian-guo XU Min GUO Xi-rong |
| Affiliation: | 1.Department of Pediatrics,Nanjing General Hospital of Nanjing Military Command,PLA,Nanjing 210002,Jiangsu,China;2.Department of General Surgery,Nanjing Children′s Hospital Affiliated to Nanjing Medical University,Nanjing 210008,Jiangsu,China;3.Department of Pediatrics,Nanjing Maternal and Child Health Hospital of Nanjing Medical University,Nanjing 210004,Jiangsu,China) |
| Abstract: | Objective Obesity is prevalent all over the world,and it has been proved to be a disease of multifactorial inheritance.Based on the differential expression of the obesity-related novel gene six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4(STEAP4) we screened previously,this study aimed to determine its expression in the adipose tissue of obese children and investigate its bioinformatic characteristics.Methods The expression levels of STEAP4 mRNA were determined by fluorescent real-time quantitative re... |
| Keywords: | Obesity Six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4 Gene expression Computational biology |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |