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2023年许昌市新冠病毒分子流行病学特征
引用本文:王文江,张晓璐,仝玉平,赵升.2023年许昌市新冠病毒分子流行病学特征[J].中国国境卫生检疫杂志,2023(5):489-492.
作者姓名:王文江  张晓璐  仝玉平  赵升
作者单位:1. 许昌市疾病预防控制中心;2. 河南省疾病预防控制中心
摘    要:目的 动态监测河南省许昌市本土流行的新冠病毒毒株组成,及时发现新变异株,评估变异株的传播力、致病力和免疫逃逸能力等生物学特性,为疫情防控提供技术支撑。方法 采用高通量测序方法对2023年2月15-19日来自哨点医院的6例新冠病毒感染者的咽拭子标本进行全基因测序,进行序列对比和进化分析。结果 6例新冠病毒感染者样本进行全基因测序,获得6条长度为29 844~29 853 bp序列。经过Nextclade V2.11.0在线分析,6条序列均属于新冠病毒奥密克戎BA.5变异株,其中病例1为BF.7.14,其余均为BA.5.2.48分支。进化树显示6条序列位于奥密克戎BA.5进化分支,与河南省其他地市BA.5进化株位于同一分支。未发现BQ、XBB等变异株。结论 测序的6例本土病例新冠病毒均为奥密克戎变异株,BA.5.2.48分支变异株依然是许昌市优势流行毒株。

关 键 词:奥密克戎  变异株  全基因组  核苷酸
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