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2022年5—9月新疆、江苏口岸输入性新冠病毒基因型分析
作者姓名:史燕  田锋  聂国嫒  夏侯为民  张金龙  胡双双  宋严希玲  耿姣姣  杨国平  耿合员
作者单位:1. 新疆国际旅行卫生保健中心;2. 江苏国际旅行卫生保健中心(南京海关口岸门诊部);3. 韶关海关综合技术服务中心技术部;4. 乌鲁木齐海关技术中心
摘    要:目的 对新疆、江苏口岸输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)核酸阳性灭活样本开展全基因组测序,掌握输入性SARS-CoV-2基因型及分子特征,为口岸新冠肺炎疫情防控提供理论指导。方法 采用商品化荧光定量RT-PCR试剂盒检测2020年5—9月新疆、江苏口岸入境人员咽拭子样本的SARS-CoV-2核酸,检测荧光阈值小于等于32(Ct≤32)的阳性样本用华大二代测序仪进行全基因组测序。结果 2020年5—9月,共检测了新疆、江苏口岸入境人员29 917份咽拭子样本,检出输入性新冠病毒阳性人员156例,其中江苏口岸113例,新疆口岸43例。对其中41份阳性样本开展了全基因组测序,均为奥密克戎(Omicron)变异株,共15个基因型,最多的是BA.5.2变异株,有17株;其次是BA.2.75变异株,4株;此外还有BA.2、BA.5.1、BA.4等基因型。结论 及时掌握了新疆、江苏口岸输入性SARS-CoV-2变异特征,为口岸新冠肺炎防控提供了技术支持。

关 键 词:口岸  新冠病毒  变异株  基因型
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