| 猪粪便中戊肝病毒实时荧光RT-PCR定性检测方法的建立及其分子流行病学特征 |
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| 引用本文： | 李延霞,江涛,李凤琴,彭子欣,王佳慧,李楠,张宏元,张立实. 猪粪便中戊肝病毒实时荧光RT-PCR定性检测方法的建立及其分子流行病学特征[J]. 卫生研究, 2019, 0(4): 545-551,559 |
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| 作者姓名： | 李延霞 江涛 李凤琴 彭子欣 王佳慧 李楠 张宏元 张立实 |
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| 作者单位： | 四川大学华西公共卫生学院四川省食品安全监测与风险评估重点实验室;国家食品安全风险评估中心卫生部食品安全风险评估重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(No.2018YFC1602703) |
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| 摘 要： | 目的建立以TaqMan探针为基础的戊肝病毒(HEV)实时荧光RT-PCR检测方法和构建系统发育树,对戊肝病毒进行基因分型,检测中国部分省市猪场的猪粪便样本HEV污染水平。方法参照GenBank HEV基因型序列,针对HEV保守区设计引物和探针,优化反应体系,建立实时荧光RT-PCR和巢式RT-PCR检测体系。结果建立的HEV实时荧光RT-PCR检测方法的灵敏度为19.9拷贝/μL,扩增效率92.9%~109.1%,与札如病毒(Sa)、诺如病毒(Nov)、甲肝病毒(HAV)均不发生交叉反应。荧光RT-PCR检测猪粪便样本342份,其中HEV阳性样本210份,阳性率61.4%,育肥前阳性率56.6%,育肥后阳性率66.9%,育肥前后样本阳性率差异具有统计学意义(χ~2=24.8,P<0.05);经基因分型鉴定体系测定阳性毒株基因型均为HEV-4型,且存在4b、4d、4h三种基因亚型。结论中国部分省市猪场中HEV感染普遍,基因型均为HEV-4型,各省市猪场感染率和基因亚型存在差异。
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| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 实时荧光RT-PCR 巢式RT-PCR 猪粪便 |
Establishment of a method with real-time reverse transcription-polymerase chain reaction for hepatitis E virus in swine feces and its molecular epidemiology |
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| Li Yanxia,Jiang Tao,Li Fengqin,Peng Zixin,Wang Jiahui,Li Nan,Zhang Hongyuan,Zhang Lishi. Establishment of a method with real-time reverse transcription-polymerase chain reaction for hepatitis E virus in swine feces and its molecular epidemiology[J]. Journal of hygiene research, 2019, 0(4): 545-551,559 |
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| Authors: | Li Yanxia Jiang Tao Li Fengqin Peng Zixin Wang Jiahui Li Nan Zhang Hongyuan Zhang Lishi |
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| Affiliation: | (West China School of Public Health,Sichuan University,Chengdu 610041,China;Key Laboratory of Food Safety Risk Assessment of Ministry of Health,China National Center for Food Safety Risk Assessment,Beijing 100021,China) |
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