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分枝杆菌在北京水源环境中的分布:M.arupense国内首次报告
引用本文:蔡林,陈雪,赵亭,张建中. 分枝杆菌在北京水源环境中的分布:M.arupense国内首次报告[J]. 临床皮肤科杂志, 2008, 37(1): 13-16
作者姓名:蔡林  陈雪  赵亭  张建中
作者单位:北京大学人民医院皮肤科,北京,100044;北京结核病控制研究所,北京,100044
基金项目:面向21世纪教育振兴行动计划(985计划)
摘    要:目的:研究北京水源中分枝杆菌的分布,应用表型鉴定方法和分子生物学方法进行分枝杆菌鉴定,并比较两种方法的准确性和优缺点.方法:采集水源环境标本,进行分枝杆菌分离培养,通过生化反应对所有分离株进行鉴定.同时从培养菌落中提取分枝杆菌DNA,用PCR扩增65 ku热休克蛋白基因,扩增产物分别应用两种限制性内切酶BstEⅡ和Hae Ⅲ酶切,进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析和PCR产物的测序分析.结果:从30份养鱼水中分离出35株分枝杆菌.①表型鉴定结果:Runyon Ⅰ群1株,可疑为海分枝杆菌;Runyon Ⅱ群7株,确定为戈登分枝杆菌或疑似戈登分枝杆菌;Runyon Ⅲ群9株,未鉴定到种;Runyon Ⅳ群18株,其中龟-偶发分枝杆菌复合群9株,其余9株未鉴定到种.②PCR-RFLP鉴定结果:戈登分枝杆菌8株,龟-偶发分枝杆菌复合群8株(包括M.peregrinum 1株),疑似日内瓦分枝杆菌10株,其余9株未鉴定到种.③PCR产物测序鉴定:戈登分枝杆菌10株,M.arupense9株,偶发分枝杆菌7株,土分枝杆菌6株,不产色分枝杆菌1株,M.peregrinum 1株,脓肿分枝杆菌1株.结论:非结核分枝杆菌(NTM)广泛存在于养鱼水中,分枝杆菌采用65 ku热休克蛋白基因PCR扩增配合测序鉴定较传统表型鉴定和PCR-RFLP更准确.

关 键 词:分枝杆菌  非结核  表型鉴定  M.arupense  限制性片段长度多态性  序列分析
文章编号:1000-4963(2008)01-0013-04
收稿时间:2007-07-05
修稿时间:2007-08-14

Distribution of Mycobacteria in water source in Beijing area:first report of M.arupense in China
CAI Lin,CHEN Xue,ZHAO Ting,ZHANG Jian-zhong. Distribution of Mycobacteria in water source in Beijing area:first report of M.arupense in China[J]. Journal of Clinical Dermatology, 2008, 37(1): 13-16
Authors:CAI Lin  CHEN Xue  ZHAO Ting  ZHANG Jian-zhong
Abstract:
Keywords:M.arupense
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