首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
检索        

丹参2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)基因全长克隆及其生物信息学分析
引用本文:高伟,程琪庆,马晓惠,何云飞,蒋超,袁媛,黄璐琦.丹参2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)基因全长克隆及其生物信息学分析[J].中国中药杂志,2012,37(22):3365-3370.
作者姓名:高伟  程琪庆  马晓惠  何云飞  蒋超  袁媛  黄璐琦
作者单位:1. 首都医科大学中医药学院,北京,100069
2. 首都医科大学中医药学院,北京100069;中国中医科学院中药研究所,北京100700
3. 中国中医科学院中药研究所,北京100700;成都中医药大学药学院,四川成都611137
4. 中国中医科学院中药研究所,北京,100700
基金项目:国家自然科学基金项目(30901965);全国优秀博士学位论文作者专项资金项目(201188);北京市自然科学基金项目(5102009);北京市优秀人才培养资助个人项目(2011D005018000002)
摘    要:目的:从丹参毛状根中克隆2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)全长基因,并进行生物信息学分析.方法:根据丹参转录组数据提供的基因片段设计特异引物,采用RACE方法克隆SmMCS全长cDNA,并对SmMCS进行蛋白结构预测、序列多重比对和构建进化树等分析;同时采用实时定量PCR检测Ag+诱导子诱导丹参毛状根不同时期的SmMCS基因转录水平.结果:克隆的SmMCS全长cDNA由988个核苷酸组成,具有完整编码框,编码234个氨基酸,蛋白相对分子质量约24.6 kDa,等电点pI 8.53;实时定量PCR结果表明该基因受Ag+诱导后表达水平在12 h时急剧上升并达到最高值.结论:从丹参毛状根中克降得到一条SmMCS全长cDNA,为进一步研究丹参酮类成分的生物合成和萜类次生代谢提供靶基因.

关 键 词:丹参  2-C-甲基-D-赤藓糖醇2  4-环焦磷酸合成酶  cDNA末端快速扩增  生物信息学分析
收稿时间:2012/9/23 0:00:00

Cloning and bioinformatics analysis of 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase gene in Salvia miltiorrhiza
GAO Wei,CHENG Qi-qing,MA Xiao-hui,HE Yun-fei,JIANG Chao,YUAN Yuan and HUANG Lu-qi.Cloning and bioinformatics analysis of 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase gene in Salvia miltiorrhiza[J].China Journal of Chinese Materia Medica,2012,37(22):3365-3370.
Authors:GAO Wei  CHENG Qi-qing  MA Xiao-hui  HE Yun-fei  JIANG Chao  YUAN Yuan and HUANG Lu-qi
Institution:School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;College of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China
Abstract:
Keywords:Salvia miltiorrhiza  2-C-methyl-D-erythritol 2  4-cyclodiphosphate synthase  rapid-amplification of cDNA ends  bioinformatics analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号