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通用性引物RT-nPCR扩增不同基因型戊型肝炎病毒基因组的探讨
引用本文:周镇先,戴星,孟继鸿. 通用性引物RT-nPCR扩增不同基因型戊型肝炎病毒基因组的探讨[J]. 东南大学学报(医学版), 2004, 23(3): 141-144
作者姓名:周镇先  戴星  孟继鸿
作者单位:东南大学医学院附属南京第二医院,江苏,南京,210003;东南大学附属中大医院,江苏,南京,210009;东南大学基础医学院病原生物学与免疫学系,江苏,南京,210009
基金项目:国家自然科学基金资助项目 (30 2 71 2 31 )
摘    要:目的:筛选戊型肝炎病毒(HEV)通用性引物,用于不同基因型HEV基因组的逆转录一巢式聚合酶链扩增(RT-nPCR)。方法:在HEV序列保守区设计和合成A、B、C、D4组引物,用于扩增已知基因型的HEV参考株和HEVIgM阳性的临床标本.探讨扩增区域最小自由能与RT-nPCR扩增效率的关系。结果:4组引物均可扩增出不同基因型HEV基因片段.但得到的PCR滴度有差异,D组引物所得滴度最高,B组最低;54份临床标本的PCR阳性率也以D组最高、B组最低。D组引物扩增区段的RNA模板最小自由能的绝对值最低,B组的最高,与PCR扩增效率相关。结论:在HEV基因组第6296~6603核苷酸之间设计的D组通用性引物可扩增不同基因型HEV以及临床标本,扩增效率高,有较高的应用价值。

关 键 词:戊型肝炎病毒  基因型  逆转录-巢式聚合酶链反应
文章编号:1671-6264(2004)03-0141-04
修稿时间:2003-11-25

Genomic amplification of different genotypes of hepatitis E virus by RT-nPCR with universal primers
ZHOU Zhen-xian ,DAI Xing ,MENG Ji-hong. Genomic amplification of different genotypes of hepatitis E virus by RT-nPCR with universal primers[J]. Journal of Southeast Univ: Medical Sci Ed, 2004, 23(3): 141-144
Authors:ZHOU Zhen-xian   DAI Xing   MENG Ji-hong
Affiliation:ZHOU Zhen-xian 1,DAI Xing 2,MENG Ji-hong 3
Abstract:
Keywords:
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