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中国人群新等位基因HLA-B*40:74的序列分析及认定
引用本文:李晓丰,章旭,张坤莲,陈阳,刘显智,李剑平. 中国人群新等位基因HLA-B*40:74的序列分析及认定[J]. 中华微生物学和免疫学杂志, 2011, 31(12)
作者姓名:李晓丰  章旭  张坤莲  陈阳  刘显智  李剑平
作者单位:辽宁省血液中心输血医学研究所,沈阳,110044
基金项目:沈阳市科学技术计划项目
摘    要:目的 序列分析及认定1例中国人群HLA新等位基因.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCRSSOP)基因分型方法和基于测序的分型方法(sequencing-based typing,SBT),通过软件分析该基因序列及与最相近等位基因序列的差异.结果 PCR-SSOP结果显示,该样本HLA-B位点反应格局出现异常提示;测序结果最终表明其B位点第2外显子序列与所有已知HLA-B等位基因序列均不一致,与序列最相近的等位基因B* 40:01:01,在所检测的第2、3、4外显子中的差异只是在第2外显子发生了nt103G→T,nt106A→G两个核苷酸替代,并导致相应的第35位密码子由A(丙氨酸)→S(丝氨酸),第36位密码子由M(蛋氨酸)→V(缬氨酸).结论 该基因为HLA-B新等位基因,被世界卫生组织HLA因子专用术语命名委员会正式命名为HLA-B* 40:74( HWS10004518-EF458488).

关 键 词:等位基因  HLA-B*40:74  序列分析

A novel HLA allele, HLA-B * 40:74, detected in a Chinese individual
LI Xiao-feng , ZHANG Xu , ZHANG Kun-lian , CHEN Yang , LIU Xian-zhi , LI Jian-ping. A novel HLA allele, HLA-B * 40:74, detected in a Chinese individual[J]. Chinese Journal of Microbiology and Immunology, 2011, 31(12)
Authors:LI Xiao-feng    ZHANG Xu    ZHANG Kun-lian    CHEN Yang    LIU Xian-zhi    LI Jian-ping
Abstract:
Keywords:Allele  HLA-B * 40∶74  Sequencing-based typing
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