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基于TCGA数据库探索POLA2基因在肝癌中的表达及其与预后的相关性
引用本文:阳建超,程兆瑞,喻超,张艾,刘兴贵.基于TCGA数据库探索POLA2基因在肝癌中的表达及其与预后的相关性[J].南昌大学学报(医学版),2022,62(3):11.
作者姓名:阳建超  程兆瑞  喻超  张艾  刘兴贵
作者单位:贵州医科大学临床医学院 贵州医科大学附属医院肝胆外科
基金项目:国家自然科学基金(81860505,81860506);
摘    要:目的 探索DNA聚合酶α亚基B(POLA2)在肝癌中的表达,分析POLA2表达与肝癌患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库和qRT-PCR技术分析POLA2在肝癌组织及肝癌细胞中的表达水平,利用人类蛋白表达图谱(HPA)数据库评估POLA2蛋白在肝癌组织中的表达水平;应用ROC曲线评估POLA2对肝癌诊断的敏感性,采用Logistic回归分析POLA2表达与肝癌临床病理特征的相关性,通过Kaplan-Meier法、单及多因素Cox回归模型分析POLA2的表达与肝癌患者预后的关系。并进一步寻找TCGA数据库中POLA2共表达基因,进行基因本体(GO)生物功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。同时通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析POLA2与肝癌免疫浸润的相关性。结果 POLA2在肝癌组织和肝癌细胞中呈显著高表达(均P<0.05),ROC曲线下面积为0.954。POLA2表达与肝癌TNM分期、组织学分级和临床分期均密切相关(均P<0.01),单及多变量Cox分析表明高表达的POLA2可作为肝细胞癌(HCC)的独立生物学标志物。GO生物功能及KEGG通路富集分析提示,POLA2基因可能参与保持解旋酶活性和DNA依赖的ATP酶活性,主要富集于细胞周期、DNA复制和范可尼贫血通路。TIMER数据库分析显示POLA2与免疫浸润细胞(Th2细胞、B细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞)具有显著正相关(均P<0.01)。结论 POLA2表达与肝癌患者预后及免疫浸润具有相关性,可作为肝癌诊断及预后评估的重要生物学靶标。

关 键 词:肝癌  DNA聚合酶α亚基B表达  TCGA数据库  免疫浸润细胞  预后  
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